More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0084 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0084  TRP-2  100 
 
 
327 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  98.17 
 
 
327 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1504  hypothetical protein  99.69 
 
 
327 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  87.16 
 
 
329 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  50.51 
 
 
312 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  33.85 
 
 
781 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  34.88 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  39.6 
 
 
253 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  35.86 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  39.27 
 
 
251 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 
621 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  33.73 
 
 
304 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  31.6 
 
 
852 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  33.03 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  34.11 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  38.25 
 
 
291 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30.43 
 
 
1911 aa  95.9  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  35.62 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.65 
 
 
517 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.93 
 
 
742 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  32.02 
 
 
892 aa  92.8  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  31.68 
 
 
491 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
861 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.73 
 
 
826 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  32.05 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  32.42 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30 
 
 
751 aa  89.4  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.8 
 
 
325 aa  89.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  30.77 
 
 
439 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  34.57 
 
 
468 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  32.43 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  32.73 
 
 
603 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 
303 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  39.18 
 
 
1392 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  31.17 
 
 
527 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  33.05 
 
 
862 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  28.33 
 
 
319 aa  85.9  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  34.3 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 
1818 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  31.28 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
698 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  27.88 
 
 
586 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  34.43 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  33.73 
 
 
1080 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  29.96 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  29.96 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  29.87 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
882 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  29.96 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 
616 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  34.52 
 
 
1581 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  33.92 
 
 
1049 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  37.97 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  29.06 
 
 
668 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  29.91 
 
 
877 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.87 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.06 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  30.7 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  30.98 
 
 
957 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  34.6 
 
 
535 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  32.25 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  31.37 
 
 
600 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
416 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  33.5 
 
 
416 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  30.67 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  31.62 
 
 
549 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  28.15 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  31.74 
 
 
766 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  32 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32.93 
 
 
444 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.94 
 
 
586 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  28.95 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  32.3 
 
 
523 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  30 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  32.65 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  29.82 
 
 
664 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  34.91 
 
 
570 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  30.2 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  29.86 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  32.78 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 
611 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.25 
 
 
628 aa  79.7  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
593 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  31.22 
 
 
929 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.23 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  33.18 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 
621 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 
442 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.34 
 
 
820 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 
1007 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  31.12 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  34.57 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  28.83 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  36.71 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  32.44 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  30.7 
 
 
616 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>