227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3720 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  100 
 
 
243 aa  493  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  100 
 
 
243 aa  493  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  100 
 
 
243 aa  493  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  100 
 
 
243 aa  493  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  100 
 
 
243 aa  493  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  100 
 
 
243 aa  493  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  100 
 
 
243 aa  493  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  95.47 
 
 
243 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  74.07 
 
 
243 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  74.07 
 
 
243 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  73.66 
 
 
243 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  75.31 
 
 
243 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  75.31 
 
 
243 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  75.31 
 
 
243 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  75.31 
 
 
243 aa  358  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  64.2 
 
 
241 aa  321  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  64.61 
 
 
241 aa  321  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  60.91 
 
 
240 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  50 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  52.84 
 
 
241 aa  225  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  52.51 
 
 
239 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  52.05 
 
 
239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  47.95 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  47.98 
 
 
241 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  47.98 
 
 
241 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  47.98 
 
 
241 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  44.8 
 
 
241 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  40.34 
 
 
246 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  39.64 
 
 
276 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  38.93 
 
 
276 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  38.93 
 
 
276 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  38.93 
 
 
276 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  38.93 
 
 
276 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  38.93 
 
 
276 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  38.93 
 
 
276 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  38.93 
 
 
276 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  38.93 
 
 
276 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  38.63 
 
 
246 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  37.27 
 
 
274 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  39.38 
 
 
277 aa  168  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  39.38 
 
 
277 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  39.15 
 
 
277 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  37.71 
 
 
245 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  39 
 
 
277 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  38.01 
 
 
274 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  38.61 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  38.22 
 
 
277 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  38.22 
 
 
277 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  36.4 
 
 
282 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  36.75 
 
 
274 aa  158  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  36.52 
 
 
286 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 
274 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  34.16 
 
 
274 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 
290 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 
290 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 
290 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 
290 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 
290 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  34.98 
 
 
248 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  36.04 
 
 
274 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  33.81 
 
 
274 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  33.81 
 
 
274 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  33.45 
 
 
274 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  33.45 
 
 
274 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  33.45 
 
 
274 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  35.53 
 
 
274 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  35.53 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  33.88 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  33.06 
 
 
306 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  28.87 
 
 
210 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  28.81 
 
 
217 aa  92  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  29.29 
 
 
210 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  30.13 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  25.77 
 
 
382 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  31.02 
 
 
215 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  31.34 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  27.57 
 
 
371 aa  89.4  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  28.4 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  30.33 
 
 
213 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  31.36 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  30.29 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  28.57 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  29.67 
 
 
223 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  29.96 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.98 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.98 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  30.99 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  26.83 
 
 
228 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  28.4 
 
 
213 aa  85.5  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  27.6 
 
 
223 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  30.2 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  26.94 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  29.18 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  28.57 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  27.43 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  27.43 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  27.43 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  28.27 
 
 
202 aa  82  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  28.22 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  30.34 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>