More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3635 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  613  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  99.35 
 
 
310 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  99.35 
 
 
310 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  99.35 
 
 
310 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  99.35 
 
 
310 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  99.35 
 
 
310 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  98.71 
 
 
310 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  89.49 
 
 
311 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  77.22 
 
 
316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  75.62 
 
 
320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  78.48 
 
 
316 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  79.37 
 
 
316 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  79.37 
 
 
316 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  80.13 
 
 
320 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  76.45 
 
 
316 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  88.24 
 
 
247 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  68.46 
 
 
277 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  54.47 
 
 
261 aa  286  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  52.68 
 
 
268 aa  251  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2625  OmpA/MotB  87.06 
 
 
85 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0480  OmpA/MotB domain-containing protein  87.06 
 
 
85 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  30.92 
 
 
463 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  33.65 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  30.13 
 
 
459 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  32.47 
 
 
464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
729 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  30.29 
 
 
464 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  48 
 
 
237 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  48 
 
 
237 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.36 
 
 
707 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  29.81 
 
 
464 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  29.18 
 
 
464 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 
227 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  45.13 
 
 
451 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 
236 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 
445 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 
231 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.6 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  27.31 
 
 
464 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 
222 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  48.48 
 
 
227 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 
441 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  43 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  42.28 
 
 
220 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 
543 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 
510 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  39.25 
 
 
424 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 
498 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.48 
 
 
248 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  46.53 
 
 
402 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  41.59 
 
 
434 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  43.56 
 
 
220 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 
206 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 
638 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 
642 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  31.25 
 
 
617 aa  92.4  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
525 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.56 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 
456 aa  92  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  43 
 
 
229 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.08 
 
 
542 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.41 
 
 
214 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 
458 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 
206 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
490 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.81 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  29.41 
 
 
652 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  48.48 
 
 
220 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 
544 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  29.83 
 
 
652 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  40.59 
 
 
222 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 
537 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  32 
 
 
658 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.89 
 
 
510 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.88 
 
 
219 aa  89.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.88 
 
 
219 aa  89.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  41 
 
 
229 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
229 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
224 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  40.4 
 
 
212 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 
440 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 
420 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 
231 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  37.1 
 
 
704 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.58 
 
 
212 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  39.02 
 
 
219 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 
219 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  31.25 
 
 
533 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  39.02 
 
 
219 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 
219 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  41 
 
 
237 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
193 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 
440 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  39.8 
 
 
210 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 
220 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 
220 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 
218 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 
220 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>