More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3506 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  99.68 
 
 
312 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  100 
 
 
312 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  98.4 
 
 
312 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  100 
 
 
312 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  100 
 
 
312 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  99.68 
 
 
312 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  99.68 
 
 
312 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  99.29 
 
 
283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  88.46 
 
 
312 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  88.46 
 
 
312 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  88.46 
 
 
312 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  88.14 
 
 
312 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  81.09 
 
 
312 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  81.73 
 
 
312 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  80.45 
 
 
320 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  78.64 
 
 
314 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  76.7 
 
 
312 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  76.7 
 
 
312 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  63.75 
 
 
311 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  64.4 
 
 
311 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  64.08 
 
 
311 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  60.06 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  60.38 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  59.81 
 
 
310 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  57.05 
 
 
319 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  56.43 
 
 
319 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  56.31 
 
 
310 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  57.28 
 
 
310 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  55.84 
 
 
311 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  57.14 
 
 
310 aa  361  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  54.52 
 
 
362 aa  360  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  54.52 
 
 
312 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  56.45 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  56.45 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  57.53 
 
 
298 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  56.71 
 
 
300 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  54.66 
 
 
310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  56.85 
 
 
298 aa  352  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  54.05 
 
 
311 aa  349  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  54.45 
 
 
300 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  53.59 
 
 
307 aa  345  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  52.58 
 
 
310 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  54.08 
 
 
300 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  54.11 
 
 
298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  54.33 
 
 
320 aa  339  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  52.05 
 
 
298 aa  326  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 
316 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  50.17 
 
 
302 aa  315  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  51 
 
 
301 aa  315  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  39.17 
 
 
318 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  41.14 
 
 
318 aa  218  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  39.35 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  38.66 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  38.1 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  37.14 
 
 
327 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 
312 aa  205  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  36.73 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  36.42 
 
 
324 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  34.92 
 
 
324 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  36.11 
 
 
323 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  35.51 
 
 
324 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  34.7 
 
 
329 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  35.8 
 
 
324 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  35.8 
 
 
324 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  35.8 
 
 
324 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  36.08 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  35.83 
 
 
326 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  34.5 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  33.98 
 
 
321 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  34.19 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  33.86 
 
 
327 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  35.78 
 
 
324 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  34.68 
 
 
339 aa  175  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  34.42 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  34.5 
 
 
326 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  34.5 
 
 
325 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  34.29 
 
 
325 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  32.39 
 
 
329 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 
325 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  31.75 
 
 
327 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  29.56 
 
 
302 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  29.29 
 
 
302 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 
302 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 
298 aa  116  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.5 
 
 
300 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  29.06 
 
 
299 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  29.85 
 
 
299 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  26.09 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  28.4 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  26.4 
 
 
298 aa  85.9  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  28.02 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  28.16 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  24.03 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.28 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  29.71 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  26.71 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>