More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3410 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  99.13 
 
 
229 aa  463  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  100 
 
 
229 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  99.55 
 
 
220 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  99.09 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  99.09 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  99.09 
 
 
220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  99.09 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  93.89 
 
 
229 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  82.35 
 
 
221 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  81.36 
 
 
220 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  82.35 
 
 
221 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  80.91 
 
 
220 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  81.45 
 
 
221 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  78.18 
 
 
220 aa  357  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  81.36 
 
 
220 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  72.69 
 
 
223 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  72.35 
 
 
223 aa  324  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  72.9 
 
 
223 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  51.39 
 
 
224 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  49.33 
 
 
226 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  48.88 
 
 
226 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  50.48 
 
 
240 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  48.83 
 
 
213 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  46.3 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  46.85 
 
 
227 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  48.34 
 
 
227 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  47.69 
 
 
214 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  47.69 
 
 
214 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 
215 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  49.06 
 
 
224 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  46.26 
 
 
212 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  47 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 
213 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  42.99 
 
 
212 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  42.15 
 
 
224 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 
218 aa  147  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  43.87 
 
 
218 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 
214 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 
185 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 
225 aa  122  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.43 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 
217 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
440 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
209 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 
214 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.49 
 
 
205 aa  112  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 
210 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
233 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
223 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 
188 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
209 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 
209 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  42.33 
 
 
205 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.68 
 
 
378 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
213 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
201 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
201 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.24 
 
 
378 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
208 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  46.63 
 
 
205 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.85 
 
 
203 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.85 
 
 
203 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  45.4 
 
 
205 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.93 
 
 
427 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.38 
 
 
203 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.94 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  26.92 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  44.25 
 
 
251 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 
209 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.85 
 
 
203 aa  99  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
207 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
198 aa  98.2  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
202 aa  98.2  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
213 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
200 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
235 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
213 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.44 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.56 
 
 
452 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 
215 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 
411 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  24.39 
 
 
203 aa  92.8  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.96 
 
 
203 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
213 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.37 
 
 
196 aa  92  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>