More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3371 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.19 
 
 
399 aa  717    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.75 
 
 
397 aa  821    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  84.45 
 
 
376 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.24 
 
 
472 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
397 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  88.35 
 
 
395 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.75 
 
 
397 aa  821    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.24 
 
 
397 aa  817    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  96.98 
 
 
394 aa  791    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  86.02 
 
 
396 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  83.91 
 
 
376 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.85 
 
 
447 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.75 
 
 
397 aa  821    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  86.61 
 
 
400 aa  709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  88.61 
 
 
395 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.85 
 
 
395 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.34 
 
 
404 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.85 
 
 
395 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  88.61 
 
 
395 aa  730    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.75 
 
 
397 aa  821    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2957  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.58 
 
 
383 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2547  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.31 
 
 
383 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0677193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2713  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.6 
 
 
383 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.46 
 
 
370 aa  578  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.51 
 
 
369 aa  554  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1567  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.41 
 
 
390 aa  551  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3143  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.89 
 
 
390 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.38 
 
 
399 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3870  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.89 
 
 
390 aa  547  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.550256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0596  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.41 
 
 
390 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.98 
 
 
375 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0320  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.84 
 
 
387 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0549  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.87 
 
 
390 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0466  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.75 
 
 
398 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114256  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1789  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.13 
 
 
393 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.54 
 
 
370 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4479  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.38 
 
 
390 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0710937 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1506  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.67 
 
 
385 aa  534  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.966603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.63 
 
 
367 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0626  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.6 
 
 
405 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.91 
 
 
377 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.65 
 
 
374 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.91 
 
 
374 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.91 
 
 
374 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.91 
 
 
374 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.65 
 
 
374 aa  521  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.38 
 
 
374 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.38 
 
 
374 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.91 
 
 
374 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.18 
 
 
377 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.38 
 
 
374 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.11 
 
 
374 aa  522  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.65 
 
 
374 aa  521  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.38 
 
 
374 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
377 aa  520  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
367 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.75 
 
 
385 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.11 
 
 
375 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.84 
 
 
375 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.11 
 
 
375 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.78 
 
 
379 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.11 
 
 
375 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.11 
 
 
375 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.93 
 
 
387 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.66 
 
 
387 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  66.58 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.12 
 
 
381 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.67 
 
 
374 aa  501  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  64.44 
 
 
382 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.53 
 
 
381 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.39 
 
 
381 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.9 
 
 
378 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.94 
 
 
374 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.78 
 
 
375 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.12 
 
 
370 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.17 
 
 
375 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.39 
 
 
374 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.39 
 
 
374 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.39 
 
 
374 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.64 
 
 
373 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.37 
 
 
370 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.76 
 
 
374 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.23 
 
 
374 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.23 
 
 
383 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.32 
 
 
375 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.23 
 
 
383 aa  487  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.59 
 
 
372 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.23 
 
 
376 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.26 
 
 
383 aa  478  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.59 
 
 
371 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.59 
 
 
377 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.97 
 
 
371 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>