47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2808 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2808  hypothetical protein  100 
 
 
899 aa  1682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0628  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497536  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1699  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2686  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2903  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.314108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2384  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2743  hypothetical protein  98.57 
 
 
70 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2988  hypothetical protein  78.72 
 
 
60 aa  84.7  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397696  normal  0.373274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0105  hypothetical protein  68.75 
 
 
63 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0086  hypothetical protein  68.75 
 
 
63 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1783  hypothetical protein  58.62 
 
 
58 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0846066  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2107  hypothetical protein  58.62 
 
 
58 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45526  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5138  hypothetical protein  72.73 
 
 
63 aa  78.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.26264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0369  hypothetical protein  80 
 
 
67 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1275  hypothetical protein  69.81 
 
 
58 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1693  hypothetical protein  59.32 
 
 
63 aa  77  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0301562  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3516  hypothetical protein  86.05 
 
 
61 aa  76.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.196587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2641  hypothetical protein  72 
 
 
63 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2341  hypothetical protein  78.05 
 
 
68 aa  71.6  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2719  hypothetical protein  78.05 
 
 
68 aa  71.6  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3480  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.79 
 
 
627 aa  67.8  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3581  hypothetical protein  63.27 
 
 
58 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972578  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4658  hypothetical protein  63.27 
 
 
58 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2207  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.14 
 
 
636 aa  67  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3366  hypothetical protein  65.85 
 
 
48 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.278826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39700  hypothetical protein  65.85 
 
 
48 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02295  hypothetical protein  70.45 
 
 
58 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1780  hypothetical protein  56.25 
 
 
58 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.219233  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0305  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  65.85 
 
 
629 aa  63.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113243 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2768  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  75.76 
 
 
608 aa  61.2  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.722905  hitchhiker  0.0000187982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0861  hypothetical protein  69.7 
 
 
64 aa  59.7  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0019  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  58.54 
 
 
50 aa  56.6  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00405758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4059  hypothetical protein  59.46 
 
 
54 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0023  hypothetical protein  65.79 
 
 
53 aa  55.1  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0051  hypothetical protein  58.54 
 
 
54 aa  53.9  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0426  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.05 
 
 
893 aa  52.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0455  hypothetical protein  56.41 
 
 
61 aa  52.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.73 
 
 
705 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.63 
 
 
718 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.38 
 
 
695 aa  47  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50 
 
 
730 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.28 
 
 
706 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.78 
 
 
721 aa  46.2  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.88 
 
 
630 aa  45.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.51 
 
 
719 aa  45.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.52 
 
 
692 aa  44.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0646  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.61 
 
 
696 aa  44.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>