More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2629 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  100 
 
 
474 aa  944    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  100 
 
 
347 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  99.71 
 
 
347 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  99.71 
 
 
347 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  99.71 
 
 
347 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  99.71 
 
 
347 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  99.67 
 
 
306 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  93.02 
 
 
358 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  85.81 
 
 
308 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  87.04 
 
 
302 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  87.38 
 
 
306 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  87.38 
 
 
305 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  85.95 
 
 
349 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  87.38 
 
 
305 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  86.71 
 
 
302 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  77.49 
 
 
315 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  76.68 
 
 
317 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  75.88 
 
 
358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  61.51 
 
 
311 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  60.91 
 
 
316 aa  346  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  56.03 
 
 
318 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  55.1 
 
 
319 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  55.56 
 
 
318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  55.6 
 
 
323 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  58.73 
 
 
298 aa  286  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  55.98 
 
 
301 aa  286  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  55.86 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  55.86 
 
 
346 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  55.12 
 
 
308 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  48.68 
 
 
327 aa  276  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  53.52 
 
 
330 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  53.01 
 
 
345 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  51.87 
 
 
293 aa  265  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  51.89 
 
 
346 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  49.83 
 
 
348 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  53.6 
 
 
302 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  53.09 
 
 
216 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  59.54 
 
 
223 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  37.58 
 
 
334 aa  184  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  37.74 
 
 
335 aa  184  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  38.87 
 
 
320 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  38.15 
 
 
311 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  39.61 
 
 
273 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36.65 
 
 
256 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  36.74 
 
 
333 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  36 
 
 
275 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  36.36 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  35.94 
 
 
260 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  36.36 
 
 
320 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  35.2 
 
 
728 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  34.69 
 
 
751 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  36.84 
 
 
727 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  36.09 
 
 
728 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.07 
 
 
275 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  35.27 
 
 
324 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  34.7 
 
 
275 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  36.33 
 
 
346 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  37.4 
 
 
262 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  35.16 
 
 
259 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  34.64 
 
 
310 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.61 
 
 
263 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  34.56 
 
 
667 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  36.73 
 
 
299 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  35.52 
 
 
733 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  37.38 
 
 
798 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  37.38 
 
 
796 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35.21 
 
 
300 aa  150  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  36.6 
 
 
804 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  38.41 
 
 
813 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  35 
 
 
263 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  36.6 
 
 
803 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  35 
 
 
263 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  37.06 
 
 
852 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  36.6 
 
 
803 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  36.6 
 
 
803 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  35 
 
 
263 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  34.58 
 
 
263 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.58 
 
 
263 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.58 
 
 
263 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  37.41 
 
 
920 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  37.41 
 
 
930 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.58 
 
 
263 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.58 
 
 
263 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  37.41 
 
 
945 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  37.41 
 
 
933 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  33.55 
 
 
304 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  38.11 
 
 
728 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.75 
 
 
263 aa  146  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.17 
 
 
263 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  43.93 
 
 
323 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  34.53 
 
 
728 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  38.59 
 
 
315 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  34.49 
 
 
767 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  40.32 
 
 
341 aa  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  34.45 
 
 
753 aa  143  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  39.31 
 
 
323 aa  143  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  33.11 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  41.4 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  36.43 
 
 
728 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  38.3 
 
 
714 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>