More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2216 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  45.97 
 
 
277 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  45.56 
 
 
292 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  45.56 
 
 
277 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  45.97 
 
 
277 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  41.26 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  44.31 
 
 
277 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  42.26 
 
 
282 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  44.23 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  44.62 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  41.84 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 
272 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
277 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  40.83 
 
 
249 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  36.89 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
259 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 
280 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  31.98 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  32.92 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
269 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.31 
 
 
425 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 
282 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.27 
 
 
260 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
268 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 
256 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 
282 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.96 
 
 
261 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 
256 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
263 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 
256 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.96 
 
 
261 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.96 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.6 
 
 
261 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
279 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.96 
 
 
392 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  30.96 
 
 
261 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 
265 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.71 
 
 
256 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  32.17 
 
 
274 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
264 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.68 
 
 
396 aa  95.5  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
269 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.3 
 
 
393 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
263 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 
260 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 
260 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 
380 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.03 
 
 
263 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
271 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 
262 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  26.87 
 
 
314 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.94 
 
 
265 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.03 
 
 
263 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.29 
 
 
263 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.9 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 
261 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
265 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.37 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
264 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  47.19 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 
265 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
259 aa  86.3  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.89 
 
 
372 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 
373 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.2 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.32 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>