More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2023 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2023  ribokinase  100 
 
 
297 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  99.66 
 
 
324 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  99.33 
 
 
324 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  93.27 
 
 
297 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  81.31 
 
 
308 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  81.66 
 
 
309 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  80.62 
 
 
308 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  82.01 
 
 
311 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  81.31 
 
 
311 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  81.31 
 
 
311 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  82.7 
 
 
310 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  77.16 
 
 
309 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  65.07 
 
 
310 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  64.71 
 
 
312 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  61.99 
 
 
306 aa  334  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  63.67 
 
 
302 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  61.25 
 
 
302 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  61.25 
 
 
302 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  62.59 
 
 
305 aa  319  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  60.21 
 
 
302 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  60.34 
 
 
308 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  58.97 
 
 
308 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  62.33 
 
 
306 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  59.4 
 
 
321 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  56.21 
 
 
315 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  56.85 
 
 
321 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  52.41 
 
 
309 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  44.75 
 
 
301 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  47.08 
 
 
305 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  51.56 
 
 
295 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  40.27 
 
 
310 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  54.08 
 
 
308 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  40.27 
 
 
310 aa  224  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  52.07 
 
 
309 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  40.89 
 
 
340 aa  223  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  43.45 
 
 
307 aa  219  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  43.64 
 
 
308 aa  218  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  53.58 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  43.99 
 
 
307 aa  215  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  46.83 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  44.55 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  55.17 
 
 
308 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  55.17 
 
 
308 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  40.96 
 
 
311 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  43.99 
 
 
305 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  40.41 
 
 
304 aa  209  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  54.83 
 
 
308 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  43.88 
 
 
308 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  50.34 
 
 
305 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  44.33 
 
 
306 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  48.31 
 
 
326 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  42.96 
 
 
305 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  45.02 
 
 
310 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  44.67 
 
 
318 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  44.33 
 
 
308 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  44.33 
 
 
308 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  44.33 
 
 
308 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  38.78 
 
 
306 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  44.91 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  43.1 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  48.46 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  45.86 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  38.19 
 
 
290 aa  199  5e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  46.42 
 
 
308 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  39.25 
 
 
304 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  39.25 
 
 
304 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.36 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  43.34 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  41.98 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  44.41 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  38.36 
 
 
309 aa  195  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  44.67 
 
 
309 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  44.67 
 
 
309 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  44.67 
 
 
309 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  44.67 
 
 
309 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  42.27 
 
 
303 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  43.99 
 
 
308 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  41.36 
 
 
303 aa  193  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  44.33 
 
 
309 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  38.1 
 
 
307 aa  192  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  37.33 
 
 
306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  37.33 
 
 
306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  37.33 
 
 
306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  37.33 
 
 
306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  37.33 
 
 
306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  37.67 
 
 
305 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  36.18 
 
 
308 aa  192  8e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  43.64 
 
 
309 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  43.64 
 
 
309 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  43.64 
 
 
309 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  43.64 
 
 
309 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  43.64 
 
 
309 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  43.64 
 
 
314 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  43.64 
 
 
314 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  43.3 
 
 
308 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  43.3 
 
 
309 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  46.92 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  41.24 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  41.24 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  43.64 
 
 
309 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>