More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1892 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
81 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  98.46 
 
 
65 aa  129  1e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  95.38 
 
 
65 aa  127  5e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
62 aa  124  4e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  80 
 
 
65 aa  112  2e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  80 
 
 
65 aa  112  2e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 
65 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 
67 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  84.13 
 
 
67 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 
65 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 
67 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  78.46 
 
 
67 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 
65 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 
67 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 
65 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 
67 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 
67 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  77.78 
 
 
73 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  76.92 
 
 
65 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 
65 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  75.38 
 
 
67 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  76.19 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 
67 aa  96.7  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 
65 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0831  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 
65 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.227484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
65 aa  74.7  4e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  58.46 
 
 
65 aa  70.9  5e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  56.92 
 
 
94 aa  69.7  1e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 
65 aa  68.9  2e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  2.90331e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  58.73 
 
 
65 aa  69.3  2e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  68.2  3e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  68.6  3e-11  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.72022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  68.2  3e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  67.4  6e-11  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  66.2  1e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  52.31 
 
 
64 aa  64.7  4e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  64.3  5e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  63.9  7e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  63.2  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  62.8  1e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  63.5  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  63.2  1e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  63.5  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  62.8  1e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
64 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
64 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  62.8  2e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  7.71602e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  62.8  2e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  62.8  2e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  1.05441e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
64 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  62.4  2e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
65 aa  62.8  2e-09  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.44382e-09  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  62.4  2e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  61.6  3e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.54984e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  61.6  3e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.39111e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  55.38 
 
 
64 aa  61.6  3e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.81829e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  61.2  4e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.15801e-07  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  61.2  4e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.62638e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  61.2  5e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
63 aa  61.2  5e-09  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  60.8  6e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  60.8  6e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.37036e-06  hitchhiker  7.46157e-05 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
66 aa  60.8  6e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  60.8  6e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.90106e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.87397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  60.5  8e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  60.1  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  8.37501e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  60.1  1e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.43878e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  60.1  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.06642e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
64 aa  59.3  1e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
79 aa  60.1  1e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  60.1  1e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.25235e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  60.1  1e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.22256e-05  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  59.7  1e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  47.69 
 
 
66 aa  59.7  1e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.46297e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  60.1  1e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.91739e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  60.1  1e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.30929e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
64 aa  58.9  2e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.48702e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  58.9  2e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  59.3  2e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.22543e-05  hitchhiker  2.19314e-05 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  58.9  2e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>