More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1855 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 
313 aa  640  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  641  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  641  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  641  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  641  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  641  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  641  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  98.08 
 
 
313 aa  630  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  82.75 
 
 
313 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  82.43 
 
 
313 aa  539  1e-152  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  83.77 
 
 
313 aa  539  1e-152  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  82.43 
 
 
313 aa  539  1e-152  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  82.43 
 
 
313 aa  539  1e-152  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  81.15 
 
 
313 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  81.15 
 
 
313 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  72.17 
 
 
312 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  72.17 
 
 
312 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  72.49 
 
 
312 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  64.31 
 
 
315 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  64.31 
 
 
315 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  64.31 
 
 
315 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  63.84 
 
 
315 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  63.43 
 
 
322 aa  398  1e-110  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  62.1 
 
 
331 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  7.20419e-06 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  61.44 
 
 
331 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  62.75 
 
 
317 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  63.4 
 
 
317 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  63.19 
 
 
315 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  62.21 
 
 
332 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
336 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  61.56 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
336 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
354 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
316 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  61.56 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 
354 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  61.04 
 
 
313 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
316 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
336 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
336 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  57.62 
 
 
315 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  57.98 
 
 
323 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  56.09 
 
 
336 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  60.13 
 
 
332 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  61.67 
 
 
317 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  60.39 
 
 
316 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  56.95 
 
 
315 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  56.95 
 
 
315 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  57.28 
 
 
315 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  56.95 
 
 
315 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  56.62 
 
 
315 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  56.29 
 
 
315 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  59.09 
 
 
314 aa  358  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  59.15 
 
 
314 aa  356  3e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  58.82 
 
 
312 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
334 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  52.4 
 
 
323 aa  341  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  52.08 
 
 
322 aa  337  2e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  51.76 
 
 
322 aa  335  6e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  51.44 
 
 
322 aa  335  8e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  56.03 
 
 
355 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  51.76 
 
 
322 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  51.44 
 
 
322 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  51.44 
 
 
322 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  52.09 
 
 
323 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  52.09 
 
 
323 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  52.09 
 
 
323 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  52.09 
 
 
323 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  52.09 
 
 
323 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  52.09 
 
 
323 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  52.41 
 
 
430 aa  332  7e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  52.09 
 
 
431 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  54.4 
 
 
318 aa  328  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  55.05 
 
 
312 aa  321  1e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  54.66 
 
 
311 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 
327 aa  307  1e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  53.95 
 
 
308 aa  307  2e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
329 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
329 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
327 aa  304  1e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  47.35 
 
 
310 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  47.35 
 
 
310 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
308 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
352 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
310 aa  270  3e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 
310 aa  270  3e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
323 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
328 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
328 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
315 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
328 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 
324 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  43.99 
 
 
305 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
351 aa  221  1e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
351 aa  221  1e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
351 aa  221  1e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
351 aa  221  1e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
351 aa  221  1e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  42.71 
 
 
351 aa  221  1e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
351 aa  221  1e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>