More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1751 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  99.58 
 
 		 236 aa  473  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  99.58 
 
 		 236 aa  473  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  99.58 
 
 		 236 aa  473  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  99.58 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  99.1 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.37 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  41.94 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.99 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  37.44 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  37.44 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  37.44 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  50.74 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2907  OmpA/MotB family outer membrane protein  51.91 
 
 		 372 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  51.69 
 
 		 278 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  36.4 
 
 		 220 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  36.4 
 
 		 220 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6867  OmpA/MotB domain protein  51.91 
 
 		 371 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301365  normal  0.329522 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  37.26 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.4 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.97 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.53 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  36.86 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  44 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  44 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  45.86 
 
 		 290 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2065  ompA family protein  45.86 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  43.65 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  43.65 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  43.65 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  44 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  43.65 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  43.65 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  43.65 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  43.65 
 
 		 179 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  46.83 
 
 		 831 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  45.16 
 
 		 346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  45.97 
 
 		 358 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  45.16 
 
 		 346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  45.16 
 
 		 346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  45.31 
 
 		 831 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  45.16 
 
 		 346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  45.16 
 
 		 354 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  45.97 
 
 		 350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  45.31 
 
 		 831 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  45.16 
 
 		 346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  45.16 
 
 		 365 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  45.31 
 
 		 831 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  44.35 
 
 		 369 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  34.35 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.88 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.88 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  39.88 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  44.35 
 
 		 358 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  39.88 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  44.35 
 
 		 371 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  44.35 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.88 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  44.35 
 
 		 358 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.88 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  39.88 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  44.35 
 
 		 351 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  45.31 
 
 		 830 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  47.54 
 
 		 830 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.8 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5847  OmpA/MotB:SmpA/OmlA  43.8 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  40.8 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 		 215 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  44.35 
 
 		 366 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  44.35 
 
 		 361 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6884  OmpA/MotB domain protein  42.58 
 
 		 362 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177157  normal  0.158984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2929  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.76 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  43.65 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  41.3 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  41.3 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  41.3 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  36.81 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  37.09 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  41.13 
 
 		 355 aa  99  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  42.74 
 
 		 354 aa  99  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  39.23 
 
 		 491 aa  98.6  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  31.33 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6244  OmpA/MotB domain-containing protein  40.32 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  39.86 
 
 		 355 aa  92.8  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.14 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  42.28 
 
 		 371 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>