76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1723 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1546  prophage DLP12 integrase  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1723  prophage DLP12 integrase  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.241784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1525  phage integrase family site specific recombinase  80.16 
 
 
132 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  50 
 
 
387 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  50 
 
 
387 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  50 
 
 
387 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  50 
 
 
387 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  60.87 
 
 
369 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  60.87 
 
 
369 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  60.87 
 
 
369 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  60.87 
 
 
369 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  46.24 
 
 
349 aa  90.5  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  53.33 
 
 
276 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  50 
 
 
369 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  50 
 
 
341 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  60.32 
 
 
324 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  63.33 
 
 
387 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  45.74 
 
 
387 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  43.62 
 
 
384 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  59.42 
 
 
122 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  46.15 
 
 
387 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  42.55 
 
 
386 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  46.25 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  42.39 
 
 
386 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  38.3 
 
 
343 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  39.13 
 
 
367 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  43.55 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  44.07 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  37.65 
 
 
354 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  37.65 
 
 
354 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  44.07 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  39.19 
 
 
359 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  38.57 
 
 
402 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  37.93 
 
 
353 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  37.5 
 
 
340 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  41.67 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  54.55 
 
 
412 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  28.85 
 
 
251 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  31.58 
 
 
421 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  47.62 
 
 
372 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  34.74 
 
 
429 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  54.76 
 
 
407 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  37.36 
 
 
430 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  34.07 
 
 
379 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  36.05 
 
 
425 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  34.78 
 
 
337 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  32.26 
 
 
347 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  32.26 
 
 
347 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  32.81 
 
 
347 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  43.14 
 
 
339 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  41.27 
 
 
356 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  37.74 
 
 
334 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  41.18 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12333  integrase  36.76 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0292  phage integrase family protein  40.26 
 
 
354 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  40 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  25 
 
 
357 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  34.15 
 
 
617 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  34.15 
 
 
617 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  30.59 
 
 
354 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5176  integrase family protein  37.21 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.795183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  51.22 
 
 
275 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  29.85 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  46.67 
 
 
363 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  41.07 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  37.1 
 
 
338 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  30.39 
 
 
310 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  32.93 
 
 
379 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  32.86 
 
 
380 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  35.09 
 
 
331 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  35.09 
 
 
331 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.28 
 
 
351 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  45.45 
 
 
336 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  41.3 
 
 
318 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1565  integrase family protein  32.76 
 
 
376 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0206581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  46.51 
 
 
453 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>