31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1682 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 418 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  63.88 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  57.4 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  57.4 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  54.55 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  48.53 
 
 		 414 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  48.4 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  47.54 
 
 		 405 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  48.94 
 
 		 403 aa  338  8e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  43.86 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  43.86 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  43.37 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  43.13 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  46.37 
 
 		 405 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  48.01 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  37.79 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  40.58 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  34.75 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  37.23 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  28.5 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  28.73 
 
 		 579 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  31.38 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  29.06 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  23.66 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  24.53 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  24.91 
 
 		 368 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2837  hypothetical protein  25.76 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0998237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3765  phage-related major capsid protein  27.91 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3714  phage-related major capsid protein  27.91 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  24.55 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  26.9 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>