79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1320 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  323  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  323  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  323  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  323  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  323  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  99.37 
 
 
158 aa  321  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  91.14 
 
 
158 aa  296  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  80.13 
 
 
158 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  79.49 
 
 
158 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  79.49 
 
 
158 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  78.34 
 
 
158 aa  256  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  79.49 
 
 
158 aa  255  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  78.85 
 
 
158 aa  255  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  80.89 
 
 
157 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  79.62 
 
 
157 aa  249  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  77.07 
 
 
157 aa  244  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  61.29 
 
 
166 aa  184  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  51.3 
 
 
168 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  53.37 
 
 
184 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  52.76 
 
 
207 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  47.48 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  51.28 
 
 
175 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  51.66 
 
 
180 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  48.73 
 
 
165 aa  144  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52 
 
 
166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  51.28 
 
 
165 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.8 
 
 
190 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  46.84 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  48.21 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  49.06 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.65 
 
 
168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  47.44 
 
 
181 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.68 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  46.58 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0934  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  46.05 
 
 
155 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242061  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.5 
 
 
164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  46.91 
 
 
196 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.77 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  46.34 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  41.61 
 
 
168 aa  121  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  38.71 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  45.4 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  39.61 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  42.94 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  39.35 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  39.75 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3964  hypothetical protein  39.87 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0376282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3950  hypothetical protein  39.87 
 
 
165 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4024  hypothetical protein  39.87 
 
 
165 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0189613  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  37.95 
 
 
174 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.67 
 
 
173 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  36.94 
 
 
162 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  40.25 
 
 
168 aa  103  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2242  hypothetical protein  44.59 
 
 
155 aa  100  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0856  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  47.54 
 
 
137 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893895  normal  0.15216 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  34.38 
 
 
447 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  35.42 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.38 
 
 
168 aa  90.5  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.81 
 
 
172 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  39.74 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  38.31 
 
 
184 aa  87.4  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  33.54 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  34.48 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.33 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  32.64 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  33.55 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  31.9 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.1 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  34.62 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.25 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  23.23 
 
 
204 aa  67  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47529  predicted protein  26.04 
 
 
466 aa  58.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03098  T/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.85 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1611  hypothetical protein  28.26 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4358  uracil-DNA glycosylase superfamily  28.22 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3739  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.63 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1718  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.8 
 
 
195 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.187997  normal  0.135819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>