134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1288 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  94.33 
 
 
955 aa  1757  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  97.69 
 
 
953 aa  1820  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  97.48 
 
 
958 aa  1809  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  90.77 
 
 
955 aa  1701  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  95.59 
 
 
950 aa  1792  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  100 
 
 
953 aa  1952  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  94.44 
 
 
950 aa  1754  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  97.48 
 
 
958 aa  1809  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  33.96 
 
 
895 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  34.95 
 
 
890 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  34.82 
 
 
890 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  37.44 
 
 
591 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  39.93 
 
 
631 aa  412  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  35.75 
 
 
582 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  35.52 
 
 
689 aa  340  6e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  34.04 
 
 
911 aa  338  2e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  33.44 
 
 
845 aa  302  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  35.79 
 
 
676 aa  300  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  34.53 
 
 
633 aa  299  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  31.37 
 
 
979 aa  295  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  34.34 
 
 
658 aa  283  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  36.83 
 
 
627 aa  271  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  35.13 
 
 
930 aa  270  6e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  32.45 
 
 
580 aa  258  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  32.39 
 
 
515 aa  256  1e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  34.5 
 
 
841 aa  250  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  31.93 
 
 
556 aa  241  3e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  28.75 
 
 
929 aa  231  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  33.55 
 
 
574 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  28.88 
 
 
878 aa  228  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  33.87 
 
 
553 aa  218  6e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  42.49 
 
 
280 aa  214  5e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  34.04 
 
 
1051 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  46.01 
 
 
797 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  26.41 
 
 
899 aa  207  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  38.87 
 
 
295 aa  206  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  29.1 
 
 
711 aa  184  8e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  39.27 
 
 
637 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  85.86 
 
 
134 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  44.76 
 
 
848 aa  171  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.49 
 
 
713 aa  167  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09484e-07 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  49.02 
 
 
813 aa  163  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  47.3 
 
 
278 aa  163  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  44.55 
 
 
275 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  46.92 
 
 
746 aa  161  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  31.84 
 
 
443 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  36.24 
 
 
644 aa  156  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  34.52 
 
 
620 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  38.71 
 
 
778 aa  148  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  36.53 
 
 
818 aa  148  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  35.98 
 
 
621 aa  147  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  35.34 
 
 
615 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  36.16 
 
 
615 aa  145  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  35.07 
 
 
615 aa  142  4e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  42.68 
 
 
782 aa  141  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  46.93 
 
 
354 aa  139  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  47.65 
 
 
621 aa  138  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  36.76 
 
 
621 aa  137  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  37.09 
 
 
277 aa  136  2e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  43.69 
 
 
271 aa  133  2e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  42.23 
 
 
272 aa  133  2e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  46.07 
 
 
1495 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  45.51 
 
 
357 aa  130  1e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  38.35 
 
 
1448 aa  130  1e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  37.97 
 
 
1448 aa  129  2e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  36.97 
 
 
986 aa  128  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2011  hypothetical protein  76.25 
 
 
100 aa  124  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133955  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  38.34 
 
 
1580 aa  123  2e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  40.97 
 
 
1557 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  32.94 
 
 
309 aa  120  1e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1991  hypothetical protein  81.94 
 
 
142 aa  119  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  40.53 
 
 
1389 aa  117  1e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  30.12 
 
 
833 aa  117  1e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  34.62 
 
 
338 aa  116  2e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0652  DNA primase TraC  81.94 
 
 
141 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  36.96 
 
 
739 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  37.12 
 
 
297 aa  110  9e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  38.1 
 
 
368 aa  109  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  39.21 
 
 
326 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  36.14 
 
 
1077 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  37.56 
 
 
736 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  28.97 
 
 
357 aa  103  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.8393e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  28.97 
 
 
411 aa  103  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  38.22 
 
 
326 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  36.22 
 
 
744 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  31.25 
 
 
383 aa  98.2  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  26.27 
 
 
408 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  38.46 
 
 
523 aa  94.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  31.01 
 
 
1255 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0559  hypothetical protein  73.13 
 
 
248 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  26.7 
 
 
580 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  35.22 
 
 
777 aa  84.7  7e-15  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.74 
 
 
970 aa  80.5  1e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  30.17 
 
 
775 aa  80.5  1e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  37.11 
 
 
777 aa  79.3  3e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  37.11 
 
 
777 aa  79  4e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  36.27 
 
 
777 aa  79  4e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.48 
 
 
970 aa  78.2  7e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  33.8 
 
 
777 aa  77.4  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.73638e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  34.5 
 
 
775 aa  77  2e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>