More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1284 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  88.42 
 
 		 191 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  87.37 
 
 		 192 aa  333  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  87.37 
 
 		 192 aa  333  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  85.26 
 
 		 191 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  84.74 
 
 		 192 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  85.34 
 
 		 193 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  83.68 
 
 		 222 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  69.84 
 
 		 193 aa  263  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  65.08 
 
 		 197 aa  258  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  63.49 
 
 		 197 aa  255  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  63.49 
 
 		 197 aa  255  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 194 aa  253  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  62.11 
 
 		 198 aa  239  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  55.85 
 
 		 196 aa  227  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  55.85 
 
 		 196 aa  227  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  55.85 
 
 		 196 aa  227  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  55.85 
 
 		 196 aa  227  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  55.32 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  55.32 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  55.32 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  55.32 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  55.32 
 
 		 196 aa  225  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  50.54 
 
 		 192 aa  184  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  50.27 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  52.22 
 
 		 185 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  48.89 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  52.03 
 
 		 189 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  49.32 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  43.01 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  47.97 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  40.86 
 
 		 318 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.77 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  40.86 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.23 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  38.92 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.23 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  39.46 
 
 		 231 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  39.36 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  33.69 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.52 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.97 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.9 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.56 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  38.38 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  38.38 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.16 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6401  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  40.32 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.36 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.76 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  34.59 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  37.16 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  37.16 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  33.14 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  32.98 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.48 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  36.96 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  37.63 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  39.89 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 206 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  34.59 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  38.8 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  38.8 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.87 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  37.36 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  36.56 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  34.76 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.7 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.7 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.92 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  37.7 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  34.62 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>