75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1222 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  99.15 
 
 		 236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  99.58 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  87.71 
 
 		 236 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  60.28 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  56.54 
 
 		 237 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  55.65 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  54.27 
 
 		 243 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  54.35 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  42.86 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  44.66 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  37.13 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  36.16 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  38.1 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.33 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  36.27 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  37.06 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  37.06 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.75 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  35.02 
 
 		 262 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  34.6 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  30.97 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  35.58 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  32.89 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  33.49 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  33.49 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  33.49 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  33.49 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  33.49 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  33.49 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.49 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  32.74 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  26.09 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  31.82 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.63 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  32.41 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  29.41 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  30.04 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  30.04 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  30.04 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  35.19 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  34.76 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  31.12 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  28.26 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  26.34 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  31.75 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  28.17 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  29.33 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.71 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  31.02 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  33.33 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  30.3 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  26.26 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  26.36 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  29.95 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.15 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  25.27 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  28.08 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.49 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  26.49 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4406  chaperone CupC2  34.78 
 
 		 133 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  31.86 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  25 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  24.6 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  25.12 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  26.15 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03366  hypothetical protein  23.39 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.53 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  29.82 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  27.18 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>