235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1192 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  96.43 
 
 
252 aa  387  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  71.37 
 
 
250 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  69.77 
 
 
258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  73.79 
 
 
259 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  73.79 
 
 
259 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  72.18 
 
 
250 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  72.18 
 
 
250 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  72.18 
 
 
258 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  68.6 
 
 
258 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  75.4 
 
 
257 aa  317  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  66.13 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  52.38 
 
 
259 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  53.52 
 
 
258 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  55.47 
 
 
256 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  53.91 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  56.36 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  44.8 
 
 
256 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  42.91 
 
 
262 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.21 
 
 
254 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.6 
 
 
257 aa  168  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.13 
 
 
255 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  39.76 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  43.32 
 
 
262 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  43.32 
 
 
262 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  43.32 
 
 
262 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.69 
 
 
267 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.89 
 
 
257 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  36.25 
 
 
261 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  37.8 
 
 
295 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  39.53 
 
 
262 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.4 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.93 
 
 
264 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  42.11 
 
 
262 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.8 
 
 
261 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.82 
 
 
260 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.61 
 
 
264 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  41.15 
 
 
224 aa  148  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.98 
 
 
259 aa  148  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  43.23 
 
 
224 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  41.3 
 
 
262 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  41.3 
 
 
262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  41.3 
 
 
262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  41.3 
 
 
262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.37 
 
 
277 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.82 
 
 
276 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.26 
 
 
302 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  41.91 
 
 
259 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.18 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  46.12 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.42 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.3 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.9 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.97 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.49 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.35 
 
 
258 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.65 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.3 
 
 
256 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.51 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.05 
 
 
280 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.44 
 
 
265 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  35.08 
 
 
247 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  35.08 
 
 
247 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.08 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.2 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.64 
 
 
248 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  31.67 
 
 
260 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  28.1 
 
 
250 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  35.2 
 
 
247 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  35.2 
 
 
247 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  35.2 
 
 
247 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
270 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  35.2 
 
 
247 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.92 
 
 
253 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.61 
 
 
275 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.78 
 
 
275 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  37.04 
 
 
260 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.61 
 
 
275 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.33 
 
 
270 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.89 
 
 
248 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.08 
 
 
247 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  33.84 
 
 
262 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.85 
 
 
248 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.05 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  37.55 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.1 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  34.41 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.66 
 
 
248 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  37.55 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.82 
 
 
290 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  37.55 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.83 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>