47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1147 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1147  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00273813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0267  hypothetical protein  97.08 
 
 
306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000473474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0881  hypothetical protein  97.08 
 
 
306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000368123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0944  hypothetical protein  97.08 
 
 
306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0686007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0994  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0987  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000850612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0789  hypothetical protein  95.95 
 
 
222 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2518  hypothetical protein  80.18 
 
 
223 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2493  hypothetical protein  80.18 
 
 
223 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1882  hypothetical protein  80.18 
 
 
223 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0802  hypothetical protein  79.28 
 
 
223 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5825  hypothetical protein  77.48 
 
 
223 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2411  hypothetical protein  77.48 
 
 
223 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0337144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2540  hypothetical protein  77.48 
 
 
223 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551168  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3247  hypothetical protein  29.07 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2588  hypothetical protein  31.78 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5207  hypothetical protein  32.78 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.371922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5893  hypothetical protein  32.04 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.369953  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0831  hypothetical protein  28.89 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.398409  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2077  hypothetical protein  27.72 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1146  hypothetical protein  25.12 
 
 
227 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5555  Protein of unknown function DUF2278  30.05 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794504  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1166  hypothetical protein  25.12 
 
 
227 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1257  hypothetical protein  25.12 
 
 
227 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0189  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.992964 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0993  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1325  hypothetical protein  24.19 
 
 
227 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000993425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0195  hypothetical protein  28.35 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0377227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1367  hypothetical protein  25.76 
 
 
227 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1140  hypothetical protein  25.25 
 
 
227 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1402  hypothetical protein  25.25 
 
 
227 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4042  hypothetical protein  25.25 
 
 
227 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2485  hypothetical protein  28.57 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1301  hypothetical protein  24.11 
 
 
227 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0952  hypothetical protein  25.44 
 
 
227 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1153  hypothetical protein  24.44 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1875  hypothetical protein  32.77 
 
 
197 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1902  hypothetical protein  21.9 
 
 
220 aa  55.8  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2481  hypothetical protein  22.84 
 
 
231 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1547  hypothetical protein  38.37 
 
 
242 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2100  hypothetical protein  23.44 
 
 
220 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0318344  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2074  hypothetical protein  22.56 
 
 
221 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00116266  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08549  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 
399 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2457  hypothetical protein  42.42 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0310  hypothetical protein  25.14 
 
 
218 aa  46.2  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000655656 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03243  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0554408  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2147  hypothetical protein  21.99 
 
 
212 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.94872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>