More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0700 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2894  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
356 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0535  ABC transporter, ATP-binding protein  99.69 
 
 
347 aa  620  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0122  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
356 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1466  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
356 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3152  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
318 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0700  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
318 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.430015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0517  ABC transporter, ATP-binding protein  99.37 
 
 
347 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7429  ABC efflux pump, ATPase subunit  56.19 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0346135  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6511  ABC transporter related  54.18 
 
 
340 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192543  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5655  ABC transporter related  54.18 
 
 
337 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305234  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6020  ABC transporter related  54.18 
 
 
337 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.628016  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6132  ABC transporter related  55.15 
 
 
337 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  decreased coverage  0.00989011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3043  ABC transporter related  36.31 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0610173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  36.22 
 
 
263 aa  96.3  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  28.62 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  31.12 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
300 aa  89  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  35.21 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  37.44 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  37.62 
 
 
374 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  33.33 
 
 
324 aa  86.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  33.96 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  30 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  32.34 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  32.26 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  34.54 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  35.78 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  32.03 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  31.72 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  25.7 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  33.64 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  27.57 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  25.7 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  34.09 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  34.2 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  30.29 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1932  ABC transporter related  31.89 
 
 
209 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.86 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  29.82 
 
 
230 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  35.11 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  27.31 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  30.33 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  29.18 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  34.2 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  34.2 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  34.2 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4044  ABC transporter related  34.8 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  33.05 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  31.1 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  34.07 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  34.2 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3454  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.52 
 
 
603 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0184148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  28.07 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  28.99 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  27.04 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1447  ABC transporter related  35.75 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.450122 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  27.68 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  33.01 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  33.82 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  28.84 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  33.83 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  29.39 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  33.5 
 
 
244 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.53 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.09 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  28.57 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  28.81 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  28.99 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  33 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  27.23 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  33.83 
 
 
239 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  28.29 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  30.29 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  36.73 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  33.18 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  32.73 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  36.04 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  31.79 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  30.22 
 
 
322 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  32.77 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  29.96 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  33.02 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  29.69 
 
 
583 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  35.9 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>