More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0587 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  100 
 
 
237 aa  468  1e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  100 
 
 
237 aa  468  1e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  100 
 
 
237 aa  468  1e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  100 
 
 
237 aa  468  1e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  99.58 
 
 
237 aa  467  1e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  100 
 
 
237 aa  468  1e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  98.73 
 
 
234 aa  437  1e-122  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  89.87 
 
 
332 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  58.62 
 
 
232 aa  241  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  50.64 
 
 
233 aa  235  5e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  56.89 
 
 
234 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  55.98 
 
 
234 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  55.98 
 
 
234 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  55.98 
 
 
234 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 
234 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  56.89 
 
 
234 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
235 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
235 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 
234 aa  214  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  54.01 
 
 
234 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  53.65 
 
 
234 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 
227 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  52.81 
 
 
234 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  54.22 
 
 
234 aa  200  2e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  50 
 
 
235 aa  197  1e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.5 
 
 
258 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 
242 aa  191  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
232 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 
228 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  45.81 
 
 
256 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 
228 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 
228 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.66 
 
 
233 aa  184  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  50.22 
 
 
231 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 
235 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
276 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 
237 aa  164  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  46.19 
 
 
241 aa  164  1e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.54 
 
 
241 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
245 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 
245 aa  155  5e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
247 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 
234 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 
243 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.29 
 
 
239 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
244 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.19132e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 
243 aa  148  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
237 aa  147  1e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
237 aa  147  1e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 
265 aa  145  8e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
237 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
238 aa  131  1e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
239 aa  119  4e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 
243 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
235 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
237 aa  114  1e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 
254 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 
244 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
254 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 
274 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  36.75 
 
 
304 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
248 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 
270 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
284 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  36.27 
 
 
282 aa  92.8  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.13 
 
 
267 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
270 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
257 aa  92  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
252 aa  92  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.717982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
252 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
252 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
252 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.07 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
317 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  27.47 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120533  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  33.93 
 
 
283 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.33 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
314 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.64 
 
 
286 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  2.00632e-05 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
273 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.16 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
272 aa  86.3  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.76 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
300 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
271 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
307 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
307 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
268 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  28.09 
 
 
413 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2769  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>