More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0535 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0344  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
320 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0535  LysR family regulatory protein  100 
 
 
362 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0356  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
362 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0306  LysR family regulatory protein  98.12 
 
 
320 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489462  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2962  LysR family transcriptional regulator  84.69 
 
 
320 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6316  LysR family transcriptional regulator  84.59 
 
 
320 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2987  LysR family transcriptional regulator  83.96 
 
 
320 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2353  LysR family transcriptional regulator  83.96 
 
 
320 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2967  LysR family transcriptional regulator  83.96 
 
 
320 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3014  LysR family transcriptional regulator  82.81 
 
 
320 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2877  LysR family transcriptional regulator  82.81 
 
 
320 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  72.84 
 
 
312 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  72.52 
 
 
312 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0155  LysR family transcriptional regulator  69.33 
 
 
312 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0458494  normal  0.226334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  41.47 
 
 
305 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 
306 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 
300 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2760  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
319 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 
300 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 
353 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  37.04 
 
 
307 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
303 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
355 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.37 
 
 
302 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.88 
 
 
299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
313 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
305 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 
367 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
367 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
305 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  41 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
351 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 
307 aa  195  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
301 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
303 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  40.07 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  38.1 
 
 
309 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
309 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
304 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
304 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
312 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  38.64 
 
 
297 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 
312 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
306 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
312 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6475  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
299 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.820215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3070  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 
304 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0273364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
301 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
309 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 
307 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 
307 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
299 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
349 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
349 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
318 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
349 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
322 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
349 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
349 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
349 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
349 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
304 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
322 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
299 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
430 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  36.49 
 
 
303 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
323 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  37.46 
 
 
302 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
322 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
322 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
305 aa  186  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
306 aa  186  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
313 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  37.54 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4422  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
302 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.481788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 
293 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1391  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>