More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0389 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 
358 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 
358 aa  727    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0389  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 
358 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3430  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 
358 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0205  CobW/P47K family protein  100 
 
 
358 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0193  CobW/P47K family protein  100 
 
 
358 aa  727    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2918  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 
358 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  90.63 
 
 
395 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  90.81 
 
 
359 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  90.56 
 
 
359 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  91.14 
 
 
393 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  89.97 
 
 
387 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  90.86 
 
 
393 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0168  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  94.97 
 
 
357 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  90.25 
 
 
388 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  84.53 
 
 
363 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  84.53 
 
 
362 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  81.62 
 
 
362 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  70.51 
 
 
359 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  68.78 
 
 
362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  70.11 
 
 
357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  66.57 
 
 
351 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  70.56 
 
 
363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  65.31 
 
 
384 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  69.92 
 
 
362 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  64.61 
 
 
350 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  65.45 
 
 
343 aa  454  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  65.45 
 
 
359 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  64.33 
 
 
352 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  63.48 
 
 
349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  64.89 
 
 
352 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  62.64 
 
 
347 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  63.48 
 
 
353 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  63.66 
 
 
369 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  62.6 
 
 
372 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  62.08 
 
 
356 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  51.27 
 
 
328 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  43.58 
 
 
323 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  44.1 
 
 
325 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  43.54 
 
 
325 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  43.71 
 
 
323 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  43.37 
 
 
325 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  43.38 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.62 
 
 
325 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  43.47 
 
 
334 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  43.18 
 
 
334 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  45.22 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  42.57 
 
 
323 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  43.26 
 
 
355 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  41.01 
 
 
361 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  40.45 
 
 
323 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  40.73 
 
 
350 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.87 
 
 
316 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.87 
 
 
319 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.87 
 
 
316 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  38.59 
 
 
316 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.87 
 
 
316 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.87 
 
 
316 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  38.87 
 
 
319 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.13 
 
 
345 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  39.44 
 
 
319 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.31 
 
 
316 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  38.59 
 
 
316 aa  262  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  41.85 
 
 
350 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  41.74 
 
 
349 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.31 
 
 
316 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  41.05 
 
 
404 aa  260  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  38.48 
 
 
320 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  41.55 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  41.29 
 
 
328 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  40.73 
 
 
347 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  38.38 
 
 
323 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  38.24 
 
 
326 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  39.04 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  39.04 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  40.62 
 
 
323 aa  252  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  42.54 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  41.52 
 
 
328 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  41.78 
 
 
358 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  38.48 
 
 
332 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  37.92 
 
 
320 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  40.38 
 
 
394 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  41.29 
 
 
343 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  41.5 
 
 
364 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  41.5 
 
 
363 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  41.08 
 
 
320 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  38.2 
 
 
320 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  39.33 
 
 
355 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  37.64 
 
 
329 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  40.11 
 
 
322 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  42.13 
 
 
354 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  38.9 
 
 
317 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36.52 
 
 
335 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  37.57 
 
 
328 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  37.57 
 
 
328 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  39.42 
 
 
339 aa  235  8e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4783  putative GTP-binding protein YjiA  38.68 
 
 
318 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4857  putative GTP-binding protein YjiA  38.18 
 
 
318 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  38.31 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4943  putative GTP-binding protein YjiA  38.4 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.715992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>