135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0309 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  91.94 
 
 
955 aa  1733  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  100 
 
 
955 aa  1957  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  94.33 
 
 
953 aa  1748  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  93.91 
 
 
953 aa  1755  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  94.47 
 
 
958 aa  1770  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  99.89 
 
 
950 aa  1945  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  94.95 
 
 
950 aa  1792  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  94.47 
 
 
958 aa  1770  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  32.72 
 
 
895 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  37.44 
 
 
591 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  34.87 
 
 
890 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  35 
 
 
890 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  40.56 
 
 
631 aa  407  1e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  35.01 
 
 
582 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  35.19 
 
 
689 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  33.86 
 
 
911 aa  338  3e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  35.79 
 
 
676 aa  303  9e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  37.95 
 
 
633 aa  300  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  34.27 
 
 
845 aa  300  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  31.72 
 
 
979 aa  298  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  33.69 
 
 
658 aa  280  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  35.25 
 
 
627 aa  272  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  34.96 
 
 
930 aa  268  3e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  32.6 
 
 
515 aa  261  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  32.28 
 
 
580 aa  256  2e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  34.71 
 
 
841 aa  253  9e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  32.3 
 
 
556 aa  240  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  33.76 
 
 
574 aa  229  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.72 
 
 
929 aa  223  2e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  34.11 
 
 
553 aa  218  3e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  34.27 
 
 
1051 aa  216  2e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  28.14 
 
 
878 aa  212  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  44.44 
 
 
280 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  44.27 
 
 
797 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  38.87 
 
 
295 aa  207  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  25.46 
 
 
899 aa  201  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  28.89 
 
 
711 aa  181  5e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  44.9 
 
 
848 aa  176  1e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  36.97 
 
 
637 aa  175  4e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  85.86 
 
 
134 aa  173  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  45.87 
 
 
746 aa  171  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  49.77 
 
 
278 aa  170  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  36.66 
 
 
644 aa  169  3e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.29 
 
 
713 aa  167  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09484e-07 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  44.39 
 
 
275 aa  166  2e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  48.26 
 
 
813 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  31.61 
 
 
443 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  36.54 
 
 
621 aa  158  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  35.92 
 
 
615 aa  151  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  34.03 
 
 
620 aa  151  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  35.66 
 
 
615 aa  149  4e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  35.66 
 
 
615 aa  147  7e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  36.44 
 
 
621 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  42.62 
 
 
782 aa  143  2e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  40.42 
 
 
818 aa  140  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  38.24 
 
 
277 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  38.43 
 
 
778 aa  139  3e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  43.28 
 
 
621 aa  135  4e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  43.28 
 
 
354 aa  135  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  43.35 
 
 
271 aa  135  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  34.63 
 
 
309 aa  134  8e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  41.87 
 
 
272 aa  129  2e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  43.28 
 
 
1495 aa  128  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35.43 
 
 
986 aa  127  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  42.79 
 
 
357 aa  126  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  41.15 
 
 
1557 aa  125  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  37.66 
 
 
1448 aa  123  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  41.15 
 
 
1389 aa  123  2e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  37.24 
 
 
1448 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2011  hypothetical protein  75 
 
 
100 aa  122  4e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1991  hypothetical protein  81.94 
 
 
142 aa  119  2e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  38.8 
 
 
1580 aa  119  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0652  DNA primase TraC  81.94 
 
 
141 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  34.63 
 
 
338 aa  110  9e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  37.22 
 
 
297 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  37.93 
 
 
368 aa  108  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  37.8 
 
 
739 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  31.97 
 
 
833 aa  106  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  30.18 
 
 
1255 aa  101  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  34.17 
 
 
1077 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  36.76 
 
 
744 aa  99  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  38.66 
 
 
523 aa  98.2  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  30.68 
 
 
383 aa  97.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  36.36 
 
 
736 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  37.67 
 
 
326 aa  93.6  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  37.22 
 
 
326 aa  92.8  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0559  hypothetical protein  73.13 
 
 
248 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  27.78 
 
 
411 aa  88.6  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  27.78 
 
 
357 aa  88.2  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.8393e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  26.45 
 
 
580 aa  83.6  1e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  35.33 
 
 
775 aa  80.9  1e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.74 
 
 
970 aa  80.1  2e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  26 
 
 
408 aa  79.3  3e-13  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  29.01 
 
 
897 aa  78.2  6e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  33.19 
 
 
777 aa  78.2  7e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  35.64 
 
 
777 aa  78.2  8e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  35.64 
 
 
777 aa  78.2  8e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  34.78 
 
 
775 aa  77.4  1e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.48 
 
 
970 aa  77.8  1e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  33.19 
 
 
777 aa  76.6  2e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>