More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0296 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  100 
 
 		 175 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  100 
 
 		 174 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  98.85 
 
 		 175 aa  330  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  95.4 
 
 		 175 aa  324  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  80.35 
 
 		 176 aa  273  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  80.35 
 
 		 176 aa  273  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  80.35 
 
 		 176 aa  273  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  80.35 
 
 		 177 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  79.77 
 
 		 176 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  80.92 
 
 		 177 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  80.35 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  58.82 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  64.71 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  60 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  57.49 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  59.88 
 
 		 191 aa  174  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  53.22 
 
 		 190 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  58.68 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  58.68 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  55.03 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  60.59 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  54.44 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  56.21 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  54.71 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  53.89 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  55.62 
 
 		 177 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  53.29 
 
 		 177 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  58.24 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  54.65 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  56.07 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  56.89 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  40.57 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  39.77 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  49.41 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  40.68 
 
 		 184 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  38.37 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  41.46 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.84 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  36.84 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36.41 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  37.8 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  37.8 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  37.8 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  38.98 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.87 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.24 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.1 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  39.02 
 
 		 186 aa  95.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  36.26 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.81 
 
 		 222 aa  94.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  38.01 
 
 		 181 aa  94  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  36.63 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.56 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.15 
 
 		 199 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  35.67 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  35.26 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.67 
 
 		 180 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.63 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  36.84 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  40.96 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  35.06 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.06 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.1 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  40.96 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  36.36 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.87 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.98 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.29 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.8 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  36.09 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  39.64 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  32.26 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  32.1 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  34.86 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  33.73 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  38.18 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  34.76 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  31.95 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  30.86 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  35.43 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.15 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  32.56 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.54 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  38.33 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  34.03 
 
 		 416 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  32.94 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  30.46 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  32.95 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  31.32 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  32.75 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.07 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.07 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  37.79 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  31.21 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  35.76 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  40.34 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  35.23 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1770  cytochrome B561  43.18 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0412177  normal  0.670754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  34.5 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>