47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0273 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  289  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  94.24 
 
 
139 aa  275  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  268  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  268  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  268  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  268  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  268  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  62.02 
 
 
129 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  56.69 
 
 
129 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2225  hypothetical protein  46.15 
 
 
131 aa  116  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  38.17 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  37.4 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  38.17 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  38.17 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  38.17 
 
 
133 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  38.17 
 
 
133 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  43.85 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0827  hypothetical protein  43.33 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000717124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0787  hypothetical protein  43.33 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  38.17 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  44.35 
 
 
165 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  44.35 
 
 
156 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  44.72 
 
 
156 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  41.04 
 
 
156 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  37.21 
 
 
130 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0281  hypothetical protein  36.15 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4379  hypothetical protein  36.43 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.73238e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5481  hypothetical protein  37.21 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  29.66 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  29.84 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  33.06 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.03 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  32 
 
 
137 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.03 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  30.22 
 
 
1420 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  26.61 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.25 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5975  hypothetical protein  29.46 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  29.91 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0827  hypothetical protein  28 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.348672  unclonable  0.00000936825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  27.42 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1640  hypothetical protein  26.89 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0534707  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  26.12 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  27.5 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>