More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0212 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  100 
 
 
236 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  99.58 
 
 
236 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  99.58 
 
 
236 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  99.58 
 
 
236 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  99.58 
 
 
236 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  99.58 
 
 
236 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  99.58 
 
 
236 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  94.49 
 
 
236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  84.75 
 
 
236 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  84.32 
 
 
236 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  83.47 
 
 
236 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  82.63 
 
 
236 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  82.63 
 
 
236 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  82.2 
 
 
236 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  81.78 
 
 
236 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  74.36 
 
 
237 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  72.65 
 
 
237 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  70.09 
 
 
237 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  52.89 
 
 
234 aa  221  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  48.93 
 
 
237 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  49.78 
 
 
234 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  51.53 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  50.22 
 
 
239 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  49.78 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  46.29 
 
 
239 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  49.56 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  49.57 
 
 
234 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  47.11 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  47.62 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  43.86 
 
 
232 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  46.55 
 
 
238 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  47.39 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  43.04 
 
 
232 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  44.1 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  43.46 
 
 
238 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  40.44 
 
 
235 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 
234 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  36.14 
 
 
231 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  41.49 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  40.11 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  39.52 
 
 
237 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  39.78 
 
 
229 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  40.57 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  42.76 
 
 
233 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  37.04 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  41.58 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  38.55 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  40.31 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  36.79 
 
 
229 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  35.5 
 
 
229 aa  124  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  40.11 
 
 
228 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  31.74 
 
 
227 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  41.12 
 
 
234 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  37.97 
 
 
238 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 
220 aa  118  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  37.84 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  34.65 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  34.65 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  34.81 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  30.64 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  30.93 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  30.93 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  44.6 
 
 
245 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 
229 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  33.03 
 
 
244 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  33.91 
 
 
230 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  37.1 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  33.62 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 
222 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  41.34 
 
 
224 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  31.78 
 
 
236 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
184 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  37.14 
 
 
243 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.7 
 
 
226 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  29.83 
 
 
251 aa  99  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  37.84 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  36.07 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  36.69 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  41.14 
 
 
288 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  32.63 
 
 
231 aa  95.5  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  32.87 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  31.75 
 
 
239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  31.75 
 
 
239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  31.75 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  31.2 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  35.08 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  27.85 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  31.28 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  32.32 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  33.62 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  38.71 
 
 
232 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  30.52 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  36.43 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  28.07 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  29.76 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  30.46 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  25.62 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>