47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2958 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  922  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  922  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  99.78 
 
 
460 aa  920  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  93.26 
 
 
460 aa  869  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  63.68 
 
 
466 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  62.36 
 
 
466 aa  577  1e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  64.19 
 
 
466 aa  572  1e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  62.88 
 
 
466 aa  573  1e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  64.19 
 
 
466 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  64.19 
 
 
466 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  54.03 
 
 
472 aa  438  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  52.8 
 
 
470 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  50.45 
 
 
499 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  47.61 
 
 
441 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  46.88 
 
 
452 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  38.69 
 
 
468 aa  303  5e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16786e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  33.73 
 
 
469 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  35.18 
 
 
538 aa  284  3e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  35.02 
 
 
538 aa  282  8e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  34.62 
 
 
538 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  35.73 
 
 
453 aa  279  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  33.41 
 
 
536 aa  277  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  35.55 
 
 
519 aa  270  6e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  36.05 
 
 
459 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  35.84 
 
 
432 aa  267  3e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  35.95 
 
 
478 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  36.32 
 
 
456 aa  267  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  34.14 
 
 
480 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  34.97 
 
 
458 aa  266  6e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  34.3 
 
 
432 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  33.04 
 
 
440 aa  259  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  36.67 
 
 
427 aa  254  2e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  34.84 
 
 
438 aa  243  4e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  31.49 
 
 
578 aa  235  1e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  32.54 
 
 
434 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  32.06 
 
 
436 aa  223  5e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  32.06 
 
 
436 aa  223  5e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  31.82 
 
 
436 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  30 
 
 
441 aa  214  2e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  30.62 
 
 
435 aa  214  3e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  31.26 
 
 
437 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  28.54 
 
 
435 aa  199  1e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.78 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  38.89 
 
 
453 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  38.89 
 
 
453 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 
451 aa  43.9  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0450  Microtubule-severing ATPase  36.36 
 
 
430 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.330417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>