100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2843 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  100 
 
 
191 aa  350  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  100 
 
 
172 aa  350  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  100 
 
 
172 aa  350  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  100 
 
 
172 aa  350  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  100 
 
 
172 aa  350  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  100 
 
 
172 aa  350  7e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  100 
 
 
179 aa  350  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  95.35 
 
 
172 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  78.05 
 
 
171 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  43.92 
 
 
156 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  46.21 
 
 
192 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  38.22 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  34.87 
 
 
180 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  35.67 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.33 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  41.98 
 
 
167 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  41.98 
 
 
167 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  41.98 
 
 
167 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  41.98 
 
 
167 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  40.62 
 
 
180 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  34.78 
 
 
166 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  35.71 
 
 
163 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  35.71 
 
 
163 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  42.74 
 
 
171 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  35.1 
 
 
210 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  35.71 
 
 
163 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  35.71 
 
 
163 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  34.44 
 
 
180 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  38.52 
 
 
167 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  36.09 
 
 
187 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  37.04 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  33.61 
 
 
156 aa  92  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  36.13 
 
 
199 aa  91.3  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  37.21 
 
 
160 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  37.5 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  42.11 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  42.11 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  42.11 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  36.88 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  35.16 
 
 
151 aa  87.8  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  39.32 
 
 
166 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  31.25 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  39.22 
 
 
179 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  38.14 
 
 
166 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  36.67 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  34.81 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  34.13 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  33.86 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  29.69 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  33.08 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  34.65 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.28 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  29.75 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  31.93 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  29.51 
 
 
179 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  27.74 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  29.51 
 
 
179 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.67 
 
 
210 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  29.27 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  34.34 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  34.34 
 
 
204 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  34.34 
 
 
204 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  34.34 
 
 
292 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  38.37 
 
 
202 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  31.87 
 
 
202 aa  57.8  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  37.21 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  37.21 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  37.21 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  37.21 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  37.21 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  37.21 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  28.48 
 
 
240 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  28.48 
 
 
240 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  27.85 
 
 
240 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  29.9 
 
 
190 aa  55.1  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  31.19 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  26.9 
 
 
240 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  24.11 
 
 
207 aa  51.2  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  25.38 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  23.44 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  30.21 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  22.9 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3128  hypothetical protein  30.32 
 
 
150 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000351189  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  30.97 
 
 
150 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  26.53 
 
 
193 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  27.63 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  23.94 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2179  putative lipoprotein  24.59 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000218689  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  26.28 
 
 
193 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  26.28 
 
 
193 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  26.28 
 
 
193 aa  45.1  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  30 
 
 
172 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  28.41 
 
 
212 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  25.24 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  22.6 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  26.47 
 
 
181 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  25.55 
 
 
193 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  24.73 
 
 
265 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>