146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2830 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  94.68 
 
 
456 aa  690    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  99.37 
 
 
492 aa  932    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  78.85 
 
 
427 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  95.94 
 
 
492 aa  733    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  95.94 
 
 
492 aa  733    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  96.98 
 
 
488 aa  764    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  948    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  95.94 
 
 
492 aa  733    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  67.93 
 
 
367 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  50 
 
 
337 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  46.79 
 
 
388 aa  283  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  44.78 
 
 
388 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  44.39 
 
 
357 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  42.82 
 
 
366 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  42.52 
 
 
349 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  38.95 
 
 
353 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  38.04 
 
 
353 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  36.26 
 
 
349 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  40.81 
 
 
348 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  40.81 
 
 
348 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  39.2 
 
 
328 aa  209  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  41.01 
 
 
377 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  37.6 
 
 
370 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  38.83 
 
 
336 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  35.67 
 
 
349 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  35.67 
 
 
349 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  35.67 
 
 
349 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  36.14 
 
 
357 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  33.93 
 
 
362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  38.89 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  38.89 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  38.89 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  38.89 
 
 
361 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  38.89 
 
 
361 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  38.89 
 
 
361 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  36.05 
 
 
346 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  33.51 
 
 
341 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  37.69 
 
 
361 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  31.71 
 
 
331 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  31.71 
 
 
331 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  33.24 
 
 
341 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  33.24 
 
 
341 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  36.69 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  36.24 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  32.37 
 
 
311 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  31.44 
 
 
331 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  38.07 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  34.73 
 
 
352 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  29.19 
 
 
356 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  29.81 
 
 
356 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  29.81 
 
 
356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.63 
 
 
343 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  29.81 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  29 
 
 
356 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.56 
 
 
385 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  43.67 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  28.78 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  32.22 
 
 
345 aa  116  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.76 
 
 
349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  25.6 
 
 
329 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.79 
 
 
332 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  28.88 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.46 
 
 
344 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.23 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  26.93 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  23.64 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  27.76 
 
 
366 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  26.54 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  27.56 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  27.03 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5983  type VI secretion protein  26.82 
 
 
377 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  26.91 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  27.56 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  29.21 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  28.87 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  28.87 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  25.83 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  27.03 
 
 
366 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0443  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2079  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  25.57 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0744  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1039  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0794  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.990033  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0705  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2013  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  26.01 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  25.83 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.74 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  24.09 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  23.13 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  25.3 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  26.24 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>