More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2780 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 598 aa  1211    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0284  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  91.68 
 
 		 553 aa  1021    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 		 598 aa  1211    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  99.64 
 
 		 553 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  48.28 
 
 		 555 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  48.63 
 
 		 555 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  48.56 
 
 		 555 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  48.56 
 
 		 555 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  48.22 
 
 		 563 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  48.18 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  47.12 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  45.93 
 
 		 560 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  44.67 
 
 		 559 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  42.5 
 
 		 551 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  39.7 
 
 		 559 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  40.76 
 
 		 554 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  40.61 
 
 		 554 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 		 575 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  40.61 
 
 		 554 aa  425  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  40.43 
 
 		 554 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 546 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 		 551 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  40.79 
 
 		 554 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 		 555 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  39.86 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 554 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  39.67 
 
 		 555 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  37.93 
 
 		 547 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.36 
 
 		 563 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.05 
 
 		 563 aa  364  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 		 547 aa  364  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  37.06 
 
 		 547 aa  359  6e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.15 
 
 		 563 aa  357  5e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  35.1 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  35.05 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 558 aa  340  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 607 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 		 612 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 596 aa  251  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 592 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 610 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 597 aa  230  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 601 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  30 
 
 		 592 aa  225  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 623 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.93 
 
 		 602 aa  223  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 601 aa  223  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 626 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 590 aa  223  9e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 609 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.54 
 
 		 610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.94 
 
 		 610 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 599 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 596 aa  217  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 602 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 598 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 611 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 599 aa  214  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 607 aa  213  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 592 aa  213  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 605 aa  213  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 609 aa  213  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 600 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 609 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 606 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 597 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 609 aa  211  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.49 
 
 		 606 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 620 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.01 
 
 		 587 aa  208  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 610 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 601 aa  207  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 598 aa  207  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  29.44 
 
 		 580 aa  207  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 607 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 599 aa  206  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 605 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 663 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 606 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 		 645 aa  205  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 590 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 598 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 604 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 633 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 608 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 604 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>