More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2656 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  99.49 
 
 
392 aa  775    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  100 
 
 
392 aa  777    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  99.49 
 
 
392 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  92.6 
 
 
392 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  99.49 
 
 
392 aa  775    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  100 
 
 
392 aa  777    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  99.49 
 
 
392 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  68.29 
 
 
397 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  67.09 
 
 
397 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  59.08 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  59.38 
 
 
392 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  53.21 
 
 
408 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  53.51 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  53.25 
 
 
401 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  51.81 
 
 
390 aa  359  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  49.1 
 
 
400 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  48.17 
 
 
393 aa  353  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  47.42 
 
 
391 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  49.09 
 
 
396 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  51.28 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  49.35 
 
 
405 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  47.68 
 
 
402 aa  336  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  51.4 
 
 
404 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  50.75 
 
 
1305 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  45.3 
 
 
403 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  47.24 
 
 
392 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  49.35 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  48.5 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  46.82 
 
 
396 aa  325  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  48.59 
 
 
400 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  48.21 
 
 
402 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  45.86 
 
 
408 aa  323  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  47.8 
 
 
391 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  48.86 
 
 
405 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  46.94 
 
 
401 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  48.96 
 
 
389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  46.25 
 
 
411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  46.72 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  55.13 
 
 
390 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  48.33 
 
 
398 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  47.41 
 
 
407 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  53.42 
 
 
402 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  53.42 
 
 
402 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  44.16 
 
 
404 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  45.48 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  45.61 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  47.7 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  45.82 
 
 
394 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  49.35 
 
 
400 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  43.43 
 
 
392 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  50.76 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  49.23 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  47.45 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  50.38 
 
 
389 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  50.13 
 
 
1230 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  42.89 
 
 
393 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  49.09 
 
 
389 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  47.27 
 
 
396 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  45.41 
 
 
395 aa  299  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.26 
 
 
416 aa  299  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  47.27 
 
 
396 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  46.29 
 
 
393 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  44.39 
 
 
404 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  46.65 
 
 
400 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  50.26 
 
 
399 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  49.62 
 
 
1228 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  49.24 
 
 
394 aa  296  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  44.7 
 
 
382 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  46.7 
 
 
392 aa  295  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  46.56 
 
 
410 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  50.13 
 
 
1230 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  47.01 
 
 
396 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  46.46 
 
 
371 aa  292  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  42.89 
 
 
397 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  46.06 
 
 
398 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  46.7 
 
 
371 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  42.47 
 
 
412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  44.76 
 
 
393 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  44.76 
 
 
393 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  45.21 
 
 
413 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  43.21 
 
 
402 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  44.33 
 
 
391 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  49.18 
 
 
385 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  42.89 
 
 
407 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  37.28 
 
 
372 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  35.41 
 
 
404 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  45.93 
 
 
367 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  37.78 
 
 
398 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  41.45 
 
 
412 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  36.87 
 
 
372 aa  255  8e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  39.3 
 
 
589 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  37.56 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  39.66 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  38.48 
 
 
394 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  42.95 
 
 
397 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  37.31 
 
 
397 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  36.91 
 
 
398 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  36.66 
 
 
398 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  40.51 
 
 
396 aa  249  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  36.59 
 
 
398 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>