96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1731 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  84.71 
 
 
504 aa  769    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  100 
 
 
498 aa  994    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  99.2 
 
 
498 aa  986    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  99.8 
 
 
498 aa  992    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  99.8 
 
 
498 aa  992    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  99.8 
 
 
498 aa  992    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  99.64 
 
 
277 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  56.06 
 
 
464 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  55.31 
 
 
463 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  56.06 
 
 
464 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  56.06 
 
 
464 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  35.16 
 
 
308 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  34.8 
 
 
306 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  34.72 
 
 
282 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  34.84 
 
 
286 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  31.27 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  31.27 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  31.27 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  31.27 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  31.27 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  31.27 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  31.27 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  31.27 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  31.12 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  30.93 
 
 
276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  29.93 
 
 
274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  29.59 
 
 
274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  29.59 
 
 
274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  29.59 
 
 
274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  30.27 
 
 
274 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  30.27 
 
 
274 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  31.36 
 
 
274 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  31.88 
 
 
274 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  30.56 
 
 
274 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  30.07 
 
 
277 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  32.7 
 
 
274 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  30.07 
 
 
277 aa  127  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  29.37 
 
 
277 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  29.72 
 
 
277 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  32.32 
 
 
274 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  29.72 
 
 
277 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  29.72 
 
 
277 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  31.08 
 
 
274 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  31.08 
 
 
290 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  31.08 
 
 
290 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  31.08 
 
 
290 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  31.08 
 
 
290 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  31.08 
 
 
274 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  30.68 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  25 
 
 
241 aa  97.1  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  24.65 
 
 
241 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  24.82 
 
 
239 aa  90.1  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  24.45 
 
 
239 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  24.62 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  23.55 
 
 
241 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  23.55 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  25.46 
 
 
241 aa  76.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  26.2 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  26.2 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  26.2 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  22.58 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  21.51 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  24.62 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  23.67 
 
 
246 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  22.94 
 
 
241 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  22.71 
 
 
245 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  21.51 
 
 
243 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  21.51 
 
 
243 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  21.51 
 
 
243 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  21.51 
 
 
243 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  21.51 
 
 
243 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  21.51 
 
 
243 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  21.51 
 
 
243 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  22.55 
 
 
243 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  24.51 
 
 
243 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  23.14 
 
 
243 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  23.14 
 
 
243 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  23.14 
 
 
243 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  21.38 
 
 
248 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  19.76 
 
 
243 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  25.35 
 
 
210 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  25.35 
 
 
210 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  22.55 
 
 
243 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  22.55 
 
 
243 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  26.12 
 
 
219 aa  47.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  24.82 
 
 
224 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  22.9 
 
 
224 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  22.43 
 
 
230 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  28.7 
 
 
227 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  24.82 
 
 
224 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  24.26 
 
 
210 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  24.31 
 
 
211 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  24.31 
 
 
211 aa  44.3  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  50 
 
 
223 aa  44.3  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  24.31 
 
 
211 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  22.28 
 
 
216 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>