More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1601 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 
145 aa  297  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  99.31 
 
 
145 aa  293  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  95.86 
 
 
145 aa  286  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  77.24 
 
 
145 aa  241  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  77.24 
 
 
145 aa  240  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  77.93 
 
 
145 aa  238  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  73.79 
 
 
145 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  72.41 
 
 
145 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  71.53 
 
 
145 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  70.83 
 
 
145 aa  219  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  70.83 
 
 
145 aa  219  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  70.83 
 
 
145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  70.14 
 
 
145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  70.14 
 
 
145 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  69.44 
 
 
145 aa  216  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  70.34 
 
 
145 aa  213  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  68.97 
 
 
145 aa  207  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  65.96 
 
 
163 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  64.54 
 
 
163 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.04 
 
 
153 aa  188  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  63.83 
 
 
163 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  59.18 
 
 
162 aa  187  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.44 
 
 
152 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  61.38 
 
 
157 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  61.11 
 
 
146 aa  185  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.17 
 
 
146 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  56.55 
 
 
145 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.33 
 
 
155 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  55.17 
 
 
145 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  57.04 
 
 
158 aa  170  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  59.57 
 
 
155 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  57.14 
 
 
159 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  58.39 
 
 
143 aa  168  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  54.86 
 
 
145 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  54.86 
 
 
153 aa  167  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  54.86 
 
 
145 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.06 
 
 
155 aa  157  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  53.79 
 
 
151 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.06 
 
 
153 aa  153  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  51.72 
 
 
151 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  49.65 
 
 
154 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  51.72 
 
 
151 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.9 
 
 
157 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  52.41 
 
 
151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.65 
 
 
153 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.72 
 
 
151 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.58 
 
 
159 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  45.58 
 
 
159 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
149 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  46.94 
 
 
159 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.03 
 
 
154 aa  146  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.71 
 
 
151 aa  146  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  44.22 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.26 
 
 
159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  46.26 
 
 
159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  53.9 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  46.67 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  53.57 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
159 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
159 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  52.14 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.19 
 
 
153 aa  144  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  51.94 
 
 
151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  49.32 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.58 
 
 
159 aa  143  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  48.23 
 
 
146 aa  143  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.52 
 
 
146 aa  142  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  44.22 
 
 
159 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  53.38 
 
 
154 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  53.68 
 
 
157 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.95 
 
 
155 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.18 
 
 
159 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.36 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  46.9 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.36 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.36 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.36 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.36 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.18 
 
 
159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  46.04 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 
156 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.5 
 
 
159 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.69 
 
 
150 aa  137  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 
150 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.64 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.5 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  50.35 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  50.35 
 
 
158 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
159 aa  137  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.64 
 
 
283 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
157 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.14 
 
 
151 aa  135  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  50.71 
 
 
157 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.21 
 
 
152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.39 
 
 
152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.85 
 
 
163 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
147 aa  133  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.68 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>