274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1559 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  99.39 
 
 
327 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  100 
 
 
327 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  100 
 
 
327 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  94.66 
 
 
281 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  36.59 
 
 
285 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  38.55 
 
 
273 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  35.71 
 
 
302 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  39.36 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  36.26 
 
 
291 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  36.46 
 
 
295 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  35.33 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  33.11 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  35.42 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  35.4 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  35.84 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  35.07 
 
 
299 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  39.24 
 
 
301 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  35.16 
 
 
308 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  35.16 
 
 
308 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  36.65 
 
 
278 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.72 
 
 
298 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  34.8 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  35.16 
 
 
308 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  35.16 
 
 
308 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  34.72 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  34.03 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  36.14 
 
 
300 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  34.64 
 
 
287 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  35.11 
 
 
299 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  34.66 
 
 
305 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  36.97 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  32.17 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  33.94 
 
 
277 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  32.16 
 
 
277 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  32.97 
 
 
280 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  31.8 
 
 
277 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  33.09 
 
 
293 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  32.51 
 
 
277 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  33.58 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  34.81 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  32.85 
 
 
277 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  32.13 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  31.83 
 
 
291 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  33.57 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  32.85 
 
 
277 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.9 
 
 
284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  35.02 
 
 
271 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  31.1 
 
 
282 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  30.32 
 
 
290 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  32.97 
 
 
270 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  28.82 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.56 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  28.42 
 
 
282 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  29.47 
 
 
283 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  28.42 
 
 
282 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  28.42 
 
 
282 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  30.43 
 
 
307 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  31.88 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  31.07 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  29.82 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  29.82 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  29.82 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  29.82 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  29.82 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  29.82 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  29.82 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  29.82 
 
 
283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  30.77 
 
 
299 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  29.27 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  29.27 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  29.27 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  29.27 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  29.27 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  29.27 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  29.27 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  30.77 
 
 
299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  32.52 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  32.52 
 
 
297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  32.52 
 
 
297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  32.52 
 
 
297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  32.52 
 
 
297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  30.14 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  32.52 
 
 
297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.05 
 
 
287 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  28.77 
 
 
306 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  29.5 
 
 
295 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.42 
 
 
288 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  28.52 
 
 
264 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  28.88 
 
 
264 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  30 
 
 
304 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  28.74 
 
 
314 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  30.82 
 
 
315 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.36 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  28.73 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08579  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 
429 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  29.33 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  29.02 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  29.9 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  27.6 
 
 
283 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  31.14 
 
 
295 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>