118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1405 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  99.72 
 
 
361 aa  686    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  100 
 
 
380 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  99.45 
 
 
361 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  99.72 
 
 
361 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  100 
 
 
361 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  100 
 
 
361 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  99.72 
 
 
361 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  96.41 
 
 
381 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  89.5 
 
 
362 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  88.67 
 
 
362 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  88.4 
 
 
362 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  86.74 
 
 
362 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  86.74 
 
 
362 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  86.74 
 
 
362 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  86.74 
 
 
362 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  72.42 
 
 
360 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  72.42 
 
 
360 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  74.3 
 
 
360 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  72.42 
 
 
361 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  75.5 
 
 
360 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  69.66 
 
 
392 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  78.06 
 
 
382 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  56.86 
 
 
360 aa  344  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  60.7 
 
 
355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  56.37 
 
 
359 aa  333  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  62.22 
 
 
361 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  56.88 
 
 
343 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  66.13 
 
 
359 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  48.03 
 
 
358 aa  322  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  60.06 
 
 
355 aa  322  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  58.03 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  54.81 
 
 
371 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  47.16 
 
 
382 aa  305  9.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  56.35 
 
 
379 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  49.86 
 
 
385 aa  296  5e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  53.17 
 
 
369 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  52.98 
 
 
365 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  46.8 
 
 
392 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  58.84 
 
 
360 aa  266  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  52.06 
 
 
360 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  42.99 
 
 
377 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  42.77 
 
 
386 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  43.75 
 
 
377 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  40.69 
 
 
365 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  45.25 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  39.36 
 
 
361 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  39.36 
 
 
361 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  39.07 
 
 
365 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  38.8 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  38.78 
 
 
370 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  43.18 
 
 
378 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  39.12 
 
 
365 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  43.17 
 
 
368 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  38.75 
 
 
364 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  38.91 
 
 
366 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  38.51 
 
 
366 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  37.08 
 
 
366 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  38.51 
 
 
366 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  38.51 
 
 
366 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  38.59 
 
 
366 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  38.26 
 
 
366 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.788667 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  38.59 
 
 
366 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  38.59 
 
 
366 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  39.08 
 
 
366 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  39.38 
 
 
366 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  37.39 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  37.5 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  38.26 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  37.39 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  37.11 
 
 
366 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  37.11 
 
 
366 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  37.11 
 
 
366 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  37.11 
 
 
366 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  37.11 
 
 
366 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  37.11 
 
 
366 aa  199  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  37.94 
 
 
366 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  34.07 
 
 
365 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  33.61 
 
 
367 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  41.46 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  33.43 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  31.25 
 
 
385 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  32.07 
 
 
365 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  33.44 
 
 
365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  32.52 
 
 
374 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  31.79 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  36.47 
 
 
440 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  24.23 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  27.17 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  22.44 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  26.67 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  27.6 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  27.87 
 
 
356 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  23.92 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.49 
 
 
358 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  22.91 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  28.98 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  23.53 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  26.97 
 
 
351 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  25.61 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  23.92 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>