153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1335 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  99.67 
 
 
302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  94.04 
 
 
302 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  67.97 
 
 
306 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  67.97 
 
 
306 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  67.97 
 
 
306 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  67.97 
 
 
306 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  68.3 
 
 
306 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  66.01 
 
 
306 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  66.34 
 
 
306 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  62.33 
 
 
303 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  58.56 
 
 
303 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  60.54 
 
 
303 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  58.17 
 
 
306 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  58.17 
 
 
306 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  58.17 
 
 
306 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  57.19 
 
 
306 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  58.5 
 
 
306 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  57.61 
 
 
306 aa  334  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  57.61 
 
 
306 aa  334  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  48.5 
 
 
303 aa  278  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  48.34 
 
 
315 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  47.87 
 
 
318 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  46.28 
 
 
305 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  50.68 
 
 
306 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  48.82 
 
 
306 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  47.44 
 
 
308 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  47.21 
 
 
308 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  45.55 
 
 
305 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  45.99 
 
 
303 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  47.22 
 
 
305 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  47.59 
 
 
306 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  45.99 
 
 
312 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  45.08 
 
 
310 aa  229  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  44.37 
 
 
321 aa  225  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  44.04 
 
 
304 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  44.04 
 
 
304 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  44.04 
 
 
321 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  44.04 
 
 
321 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  44.04 
 
 
304 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  43.71 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  42.86 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  43.71 
 
 
304 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  43.71 
 
 
304 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  41.77 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  38.49 
 
 
307 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  40.6 
 
 
300 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  38.06 
 
 
308 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  38.54 
 
 
308 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  38.49 
 
 
307 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  38.36 
 
 
308 aa  202  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  41.3 
 
 
321 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  36.99 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  41.41 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  39.86 
 
 
315 aa  195  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  38.54 
 
 
299 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  39.22 
 
 
305 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  37.76 
 
 
298 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  36.15 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  41.45 
 
 
304 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  36.9 
 
 
299 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  36.99 
 
 
299 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  38 
 
 
309 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  36.55 
 
 
299 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  32.54 
 
 
299 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  38.05 
 
 
306 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  37.07 
 
 
303 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  38.14 
 
 
306 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  34.77 
 
 
296 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  38.44 
 
 
306 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  29.59 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  31.67 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  30.29 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  30.99 
 
 
306 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  29.88 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  30.69 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  29.66 
 
 
315 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  28 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  34.02 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  31.78 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  30.59 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  28.92 
 
 
314 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  28.92 
 
 
314 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  28.67 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  29.97 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  33.06 
 
 
291 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  29.45 
 
 
296 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  31 
 
 
286 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  30.55 
 
 
309 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  28.47 
 
 
307 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  32.34 
 
 
299 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  27.37 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  29.21 
 
 
314 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  30.45 
 
 
286 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>