More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1183 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  99.68 
 
 
310 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  99.35 
 
 
344 aa  612  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  92.26 
 
 
310 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  75.32 
 
 
320 aa  468  1e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  75 
 
 
320 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  75.32 
 
 
308 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  75.57 
 
 
328 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  58.09 
 
 
306 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  7.20941e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  57 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  57 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  59.41 
 
 
309 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  57 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  57 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  57 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  58.19 
 
 
314 aa  362  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4487  carbohydrate kinase, PfkB  63.7 
 
 
308 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  57.76 
 
 
315 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  57.86 
 
 
315 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  57.86 
 
 
315 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  44.67 
 
 
308 aa  214  2e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  43.19 
 
 
308 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  39.29 
 
 
311 aa  201  2e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.94 
 
 
306 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  43.96 
 
 
309 aa  195  8e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  43.96 
 
 
309 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39.45 
 
 
299 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  40.83 
 
 
302 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  39.86 
 
 
302 aa  192  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  38.28 
 
 
304 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  44.29 
 
 
308 aa  190  3e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  41.52 
 
 
315 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  41.87 
 
 
321 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  35.69 
 
 
309 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  42.21 
 
 
321 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.67 
 
 
301 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  40.21 
 
 
295 aa  183  4e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  38.89 
 
 
308 aa  182  9e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  39.66 
 
 
312 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  37.93 
 
 
310 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  39.93 
 
 
306 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40 
 
 
305 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  39.79 
 
 
302 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  38.06 
 
 
302 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  39.66 
 
 
308 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  39.66 
 
 
308 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.63 
 
 
308 aa  175  1e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  40.67 
 
 
295 aa  174  2e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  38.41 
 
 
302 aa  174  2e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  37.63 
 
 
305 aa  172  4e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  35.01 
 
 
345 aa  172  6e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.07 
 
 
307 aa  172  8e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  44.29 
 
 
308 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  37.54 
 
 
307 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  39.31 
 
 
309 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.83 
 
 
305 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  43.94 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  43.94 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  39.2 
 
 
297 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  38.16 
 
 
302 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  40 
 
 
311 aa  165  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  40 
 
 
311 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  36.49 
 
 
398 aa  164  1e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  40 
 
 
311 aa  165  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  36.58 
 
 
316 aa  163  4e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  38.41 
 
 
319 aa  162  5e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  2.12257e-05  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  32.44 
 
 
304 aa  162  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  41.02 
 
 
301 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  36.39 
 
 
306 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  38.14 
 
 
307 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  39.39 
 
 
296 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  35.67 
 
 
308 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 
309 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  36.9 
 
 
298 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  6.79387e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  33.22 
 
 
309 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  38.89 
 
 
323 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  31.49 
 
 
308 aa  159  7e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  2.34776e-14 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  36.46 
 
 
310 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  34.25 
 
 
307 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  30.16 
 
 
308 aa  156  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  32.79 
 
 
305 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  35.47 
 
 
303 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  35.47 
 
 
303 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  33.1 
 
 
404 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  33.1 
 
 
404 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  33.1 
 
 
404 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  40.71 
 
 
324 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  33.69 
 
 
404 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  33.1 
 
 
404 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  35.74 
 
 
303 aa  154  3e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  35.31 
 
 
305 aa  153  3e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  35.82 
 
 
318 aa  153  3e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  32.3 
 
 
304 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  40.85 
 
 
310 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  32.3 
 
 
304 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  32.75 
 
 
404 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  36.9 
 
 
298 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 
308 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  35.86 
 
 
309 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  31.8 
 
 
306 aa  152  9e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>