More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1038 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 280 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  99.16 
 
 		 238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  99.55 
 
 		 221 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  88.11 
 
 		 236 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 236 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 236 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  87.67 
 
 		 236 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  87.67 
 
 		 236 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  85.11 
 
 		 236 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  44.74 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 248 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1255  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  37.44 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  32.06 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0776  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 262 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  31.89 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.5 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  33.98 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.92 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.43 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.43 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.43 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.92 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.94 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  27.94 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  28.02 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2902  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0093  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0981  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2641  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  25.48 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.28 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>