More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1037 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1828  short chain dehydrogenase  99.65 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0861  short chain dehydrogenase  99.65 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1037  short chain dehydrogenase  100 
 
 
284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1123  short chain dehydrogenase  100 
 
 
298 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0606  short chain dehydrogenase  99.62 
 
 
265 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.289606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2338  short chain dehydrogenase  99.62 
 
 
265 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4224  short chain dehydrogenase  87.55 
 
 
265 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4276  short chain dehydrogenase  87.92 
 
 
265 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222257  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4032  short chain dehydrogenase  85.45 
 
 
268 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3750  short chain dehydrogenase  87.17 
 
 
265 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759857  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4334  short chain dehydrogenase  85.45 
 
 
268 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3189  short chain dehydrogenase  84.33 
 
 
268 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1704  short chain dehydrogenase  60 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0980  short chain dehydrogenase  58.49 
 
 
263 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5536  short chain dehydrogenase  56.6 
 
 
262 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2184  short chain dehydrogenase  56.02 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.08 
 
 
258 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549001  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.37 
 
 
255 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 
258 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3899  hypothetical protein  51.18 
 
 
255 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.363357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
255 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.239762 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
255 aa  225  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.21 
 
 
263 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
255 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
264 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2147  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.49 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6225  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00892767  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2185  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.43 
 
 
250 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3073  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.44 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
250 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0474  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
254 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3752  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.46 
 
 
268 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.92 
 
 
258 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
292 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
292 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
267 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
292 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0761637  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0334  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.22 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  36.96 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
264 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.13 
 
 
258 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
245 aa  132  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1897  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.22 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0333934 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.88 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2539  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.58 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.643723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0517  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.51 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2784  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.41 
 
 
254 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.330689  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2854  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.41 
 
 
264 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110395  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
246 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.2 
 
 
258 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
249 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 
266 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1221  ketoacyl reductase  35.69 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432142  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4528  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.9 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.9 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.43 
 
 
256 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.59 
 
 
248 aa  126  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
270 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.73 
 
 
246 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10890  putative short-chain dehydrogenase  37.5 
 
 
241 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0306888  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
285 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
285 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
285 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.110576 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  33.88 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  33.47 
 
 
260 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
262 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
249 aa  125  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3073  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.65 
 
 
256 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.789258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
262 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.2 
 
 
256 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
251 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
259 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.534322  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.25 
 
 
256 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
260 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.29 
 
 
260 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
260 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.29 
 
 
260 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
251 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.96 
 
 
258 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
255 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>