More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1029 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  99.74 
 
 		 384 aa  767    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  99.74 
 
 		 384 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  100 
 
 		 384 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  99.22 
 
 		 384 aa  764    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  99.74 
 
 		 384 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  98.44 
 
 		 384 aa  759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  71.79 
 
 		 390 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  72.38 
 
 		 391 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  69.53 
 
 		 383 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  69.09 
 
 		 380 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  70.03 
 
 		 380 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  70.03 
 
 		 380 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  70.56 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  67.79 
 
 		 380 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  65.27 
 
 		 383 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  65.71 
 
 		 380 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  66.41 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  68.12 
 
 		 380 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  68.39 
 
 		 379 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  65.94 
 
 		 411 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  55 
 
 		 379 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.64 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.64 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  52.39 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.76 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.64 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  52.39 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.39 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.75 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.51 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.66 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  54.38 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  53.99 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  50.5 
 
 		 383 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  50.13 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51.37 
 
 		 381 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  52.76 
 
 		 384 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.75 
 
 		 381 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.25 
 
 		 381 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50.79 
 
 		 414 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  46.62 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  49.61 
 
 		 379 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  49.34 
 
 		 384 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.25 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  49.74 
 
 		 384 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  49.87 
 
 		 385 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  49.48 
 
 		 384 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  48 
 
 		 409 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  48 
 
 		 409 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  48.82 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  48.82 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  48.82 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  45.39 
 
 		 383 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  49.08 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  49.74 
 
 		 392 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.61 
 
 		 383 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  46.46 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  47.56 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  50.13 
 
 		 375 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  45.61 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  45.65 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  45.7 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  48.84 
 
 		 375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  45.12 
 
 		 394 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  47.99 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  47.99 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  45.86 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.66 
 
 		 363 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  44.8 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  48.25 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  48.27 
 
 		 377 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  46.41 
 
 		 386 aa  291  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  48.8 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  45.21 
 
 		 386 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  46.41 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.37 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.37 
 
 		 385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  45.64 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  47.59 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  47.19 
 
 		 391 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  46.58 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  46.58 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  46.84 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  46.84 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.84 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.84 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  46.04 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  46.58 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.17 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  45.43 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  44.64 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.18 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>