More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1016 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  99.72 
 
 
365 aa  719    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  99.44 
 
 
358 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  99.72 
 
 
365 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  99.72 
 
 
365 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  100 
 
 
358 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  99.72 
 
 
365 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  74.72 
 
 
367 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  56.94 
 
 
385 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  55.68 
 
 
369 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  53.31 
 
 
372 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.3 
 
 
381 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  47.62 
 
 
381 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  45.62 
 
 
381 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  45.73 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  45.74 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  45.11 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  45.73 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  43.62 
 
 
379 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  43.62 
 
 
379 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  44.3 
 
 
379 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  43.62 
 
 
379 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  43.62 
 
 
379 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  43.35 
 
 
379 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.42 
 
 
383 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.42 
 
 
374 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.42 
 
 
383 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  45.26 
 
 
394 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  42.78 
 
 
392 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  44.88 
 
 
375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.98 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.98 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.98 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.98 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  45.26 
 
 
394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.98 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.98 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.98 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  41.71 
 
 
414 aa  265  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  42.97 
 
 
396 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  42.09 
 
 
370 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  44.12 
 
 
383 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.77 
 
 
375 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.42 
 
 
384 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  43.42 
 
 
375 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  41.46 
 
 
381 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.21 
 
 
375 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  40.59 
 
 
383 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.21 
 
 
375 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.26 
 
 
380 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  43.16 
 
 
384 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  43.16 
 
 
384 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  43.16 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  43.16 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  43.16 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  41.26 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  41.8 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  41.8 
 
 
380 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  40.58 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  42.63 
 
 
384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.82 
 
 
385 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  40.87 
 
 
384 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.56 
 
 
385 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  40.87 
 
 
384 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  40.87 
 
 
384 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  40.21 
 
 
383 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  40.87 
 
 
384 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  40.81 
 
 
384 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  41.85 
 
 
377 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  39.89 
 
 
385 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  40.6 
 
 
380 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  40.6 
 
 
384 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  41.82 
 
 
379 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  41.08 
 
 
411 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  41.87 
 
 
381 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  43.7 
 
 
383 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  40.97 
 
 
391 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  39.64 
 
 
390 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  40.6 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  41.02 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  39.78 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  41.26 
 
 
375 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  42.05 
 
 
382 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  39.9 
 
 
383 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  39.24 
 
 
384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  40.61 
 
 
383 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  40.83 
 
 
409 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  39.28 
 
 
389 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  39.57 
 
 
389 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.74 
 
 
383 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  39.41 
 
 
387 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.74 
 
 
383 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40 
 
 
383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.43 
 
 
383 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  40.96 
 
 
389 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.95 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.79 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  38.16 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  38.11 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  39.51 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  41.44 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>