240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0818 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  100 
 
 
303 aa  620  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  99.67 
 
 
303 aa  620  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  56.51 
 
 
310 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  55.82 
 
 
310 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  53 
 
 
437 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  50.34 
 
 
433 aa  300  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  38.97 
 
 
564 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.96 
 
 
561 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.96 
 
 
562 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  35.62 
 
 
561 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.62 
 
 
561 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.62 
 
 
561 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.5 
 
 
568 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.62 
 
 
561 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.92 
 
 
562 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.62 
 
 
562 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.79 
 
 
562 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.79 
 
 
562 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.79 
 
 
562 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.43 
 
 
562 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.43 
 
 
562 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.43 
 
 
562 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.43 
 
 
562 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.96 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000192522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.04 
 
 
581 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  35.66 
 
 
578 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.4 
 
 
545 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.78 
 
 
556 aa  142  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  34.38 
 
 
300 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  34.81 
 
 
328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.22 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  32.87 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.25 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  31.02 
 
 
306 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1956  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.43 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.296795  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  32.61 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  28.57 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  30.07 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  29.87 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  29.89 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  32.3 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  29.81 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  28.57 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  32.82 
 
 
284 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  29.06 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  26.32 
 
 
312 aa  79  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  32.82 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  32.82 
 
 
284 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  33.06 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  28.57 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  27.76 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  25.52 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  27.68 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  32.31 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  30.31 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  27.84 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  26.84 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  30.92 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  30.59 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  27.6 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  29.74 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1533  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.04 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135262  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  30 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  27.41 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  31.58 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.89 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  27.27 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  28.43 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  28.89 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  29.2 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  30.2 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  34.29 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  27.65 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  28.43 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  27.44 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  29.53 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  30 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  26.37 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  26.32 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  26.97 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  29.53 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  37.5 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  28.11 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  29.53 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  28.11 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  28.77 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  29.53 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  30 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1764  2-methylisocitrate lyase  30.89 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  27.8 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  37.59 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  29.36 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  28.57 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  26.3 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  25.4 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  26.46 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00290  hypothetical protein  26.46 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  26.67 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0462  2-methylisocitrate lyase  35.34 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237337  hitchhiker  0.00000000745318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0363  2-methylisocitrate lyase  26.46 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>