More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0798 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  100 
 
 
96 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  100 
 
 
96 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
96 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  98.96 
 
 
96 aa  191  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  75.27 
 
 
129 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  71.88 
 
 
105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  70.83 
 
 
100 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  70.83 
 
 
100 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  70.83 
 
 
100 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  75.86 
 
 
100 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  73.86 
 
 
100 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  69.07 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  71.43 
 
 
103 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  70.33 
 
 
120 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  64.37 
 
 
93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  65.43 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  64.52 
 
 
108 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  60.24 
 
 
108 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  61.9 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  58.23 
 
 
111 aa  94.4  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  58.43 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  56.25 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  51.19 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  54.22 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  52.38 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  52.38 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  35.29 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.53 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  40.22 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.18 
 
 
338 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  43.18 
 
 
338 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  35.29 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.46 
 
 
365 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  38.46 
 
 
365 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.5 
 
 
363 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  39.56 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.05 
 
 
340 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.91 
 
 
345 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  38.82 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.68 
 
 
353 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  46.58 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.46 
 
 
357 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  45.07 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  37.93 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.23 
 
 
336 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0151  putative ferredoxin  35.37 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0245789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  42.05 
 
 
341 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  39.08 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  48.48 
 
 
332 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.23 
 
 
383 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.5 
 
 
349 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
360 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  37.65 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.5 
 
 
349 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.17 
 
 
350 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  40.96 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  36.47 
 
 
99 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.5 
 
 
349 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  40.96 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  37.8 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.29 
 
 
341 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  37.8 
 
 
104 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  35.63 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  39.24 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  39.24 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.97 
 
 
350 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.29 
 
 
343 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.71 
 
 
350 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.93 
 
 
354 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  44.3 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  34.72 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  41.89 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.7 
 
 
333 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.37 
 
 
354 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.22 
 
 
346 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.37 
 
 
354 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  39.08 
 
 
353 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  33.72 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.27 
 
 
585 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  44.62 
 
 
366 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  37.97 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  38.46 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  37.97 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  42.11 
 
 
627 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  32.94 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  37.8 
 
 
605 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.73 
 
 
331 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 
349 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  37.5 
 
 
350 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  37.93 
 
 
353 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.06 
 
 
669 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  35.29 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.05 
 
 
354 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  36.56 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  34.12 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  38.2 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  35.29 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  38.46 
 
 
357 aa  54.3  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  35.29 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>