94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0567 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  91.11 
 
 
405 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  100 
 
 
405 aa  799    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  100 
 
 
405 aa  799    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  100 
 
 
405 aa  799    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.6 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  35.62 
 
 
388 aa  199  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  32.38 
 
 
406 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  34.81 
 
 
409 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.9 
 
 
384 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.06 
 
 
396 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.93 
 
 
422 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2731  lipopolysaccharide biosynthesis  32.95 
 
 
394 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  30.97 
 
 
388 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 
395 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3061  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.89 
 
 
416 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  29.35 
 
 
408 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  34.48 
 
 
401 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 
398 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  28.99 
 
 
428 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  27.61 
 
 
343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1885  hypothetical protein  29.04 
 
 
370 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 
463 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  25.17 
 
 
740 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  24.81 
 
 
747 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.91 
 
 
741 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  24.54 
 
 
741 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  25.52 
 
 
741 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.52 
 
 
741 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  25.52 
 
 
741 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.75 
 
 
747 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.48 
 
 
739 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  28.63 
 
 
749 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.2 
 
 
741 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25.1 
 
 
741 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  25.19 
 
 
367 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.1 
 
 
739 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.1 
 
 
739 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  26.59 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.71 
 
 
739 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  26.55 
 
 
746 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  23.93 
 
 
748 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  26.06 
 
 
755 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.78 
 
 
730 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 
761 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  29.66 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  20.6 
 
 
741 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  25.42 
 
 
764 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  26.07 
 
 
740 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  24.6 
 
 
746 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 
643 aa  53.5  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  26.89 
 
 
745 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  23.93 
 
 
755 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  26.86 
 
 
747 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.96 
 
 
642 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  24 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  24 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  26.42 
 
 
746 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  23.11 
 
 
750 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 
324 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  20.49 
 
 
753 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  23.19 
 
 
509 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.66 
 
 
780 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  21.82 
 
 
318 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  32.08 
 
 
820 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  25.19 
 
 
740 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  24.18 
 
 
732 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  25.1 
 
 
724 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.18 
 
 
740 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  22.63 
 
 
734 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  24.93 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  20.45 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  23.43 
 
 
320 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  22.18 
 
 
744 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  22.01 
 
 
744 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  23.93 
 
 
800 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.53 
 
 
800 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  26.35 
 
 
382 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  25.21 
 
 
730 aa  47  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  26.35 
 
 
378 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  26.35 
 
 
382 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  20.51 
 
 
726 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.57 
 
 
743 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.4 
 
 
328 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.61 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  25 
 
 
472 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  21.91 
 
 
740 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  23.2 
 
 
722 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  19.55 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  20.32 
 
 
779 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  25.41 
 
 
478 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  23.18 
 
 
802 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4936  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.82 
 
 
362 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0428435  normal  0.874346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>