93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0398 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_2129  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  96.47 
 
 
495 aa  856    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0812  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  95.88 
 
 
492 aa  857    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0398  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  100 
 
 
510 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0496  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  98.04 
 
 
504 aa  855    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.774369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0282  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  85.44 
 
 
496 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1825  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  98.64 
 
 
520 aa  854    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  97.3 
 
 
470 aa  843    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.26 
 
 
477 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.58 
 
 
461 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3322  putative transporter  27.81 
 
 
476 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.871023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1908  putative transporter  27.6 
 
 
476 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  32 
 
 
460 aa  207  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3013  transporter  26.96 
 
 
476 aa  203  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000189205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3342  putative transporter  26.96 
 
 
476 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00045821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3123  transporter  26.96 
 
 
476 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000866663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3369  transporter  26.96 
 
 
476 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3342  putative transporter  26.75 
 
 
476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.82 
 
 
460 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3048  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.54 
 
 
476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0103079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3328  transporter, putative  26.54 
 
 
476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  30.32 
 
 
500 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.8 
 
 
484 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.35 
 
 
477 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262721  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4645  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.85 
 
 
477 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.46 
 
 
464 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  30.42 
 
 
513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2876  hypothetical protein  25.6 
 
 
513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586434 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  30.17 
 
 
513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  30.17 
 
 
513 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  30.17 
 
 
513 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  30.17 
 
 
513 aa  163  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  30.17 
 
 
506 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  30.17 
 
 
506 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1563  hypothetical protein  29.92 
 
 
522 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.150626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  30.17 
 
 
492 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.17 
 
 
492 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  30.92 
 
 
506 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4810  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.4 
 
 
467 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4866  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.4 
 
 
467 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000044  membrane protein  30.75 
 
 
491 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4747  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.4 
 
 
467 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2374  hypothetical protein  31.58 
 
 
492 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4716  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.18 
 
 
467 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  0.397486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1557  hypothetical protein  29.4 
 
 
522 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.750418  normal  0.28282 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1000  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.69 
 
 
497 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0219424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  30.67 
 
 
506 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.449872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  30.67 
 
 
506 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2386  hypothetical protein  27.88 
 
 
509 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  30.67 
 
 
506 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  30.67 
 
 
506 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1496  hypothetical protein  29.66 
 
 
522 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1715  hypothetical protein  30.03 
 
 
513 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4846  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.19 
 
 
467 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.9 
 
 
505 aa  160  7e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1502  hypothetical protein  29.09 
 
 
520 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342277  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  27.11 
 
 
502 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1678  hypothetical protein  28.17 
 
 
514 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113687  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0553  C4-dicarboxylate anaerobic carrier dcuC  26.8 
 
 
512 aa  158  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.693670000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0449  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.93 
 
 
467 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.935589  normal  0.0170379 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1054  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  26.98 
 
 
502 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.544295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1242  putatve dicarboxylate transporter  27.97 
 
 
502 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0072618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2242  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.25 
 
 
478 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.354885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1974  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.56 
 
 
468 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0431  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.73 
 
 
482 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73068  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1835  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.6 
 
 
492 aa  149  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.78 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313123  normal  0.0213036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2000  hypothetical protein  29.5 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0420164  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1985  hypothetical protein  29.5 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1927  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.11 
 
 
508 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.0894208 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2124  hypothetical protein  26.02 
 
 
517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2339  hypothetical protein  29.5 
 
 
481 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00278972  normal  0.0466746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2048  hypothetical protein  29.02 
 
 
481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776324  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1229  hypothetical protein  26.13 
 
 
518 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.941876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1254  hypothetical protein  26.13 
 
 
518 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.111433  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1836  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.95 
 
 
517 aa  141  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2353  hypothetical protein  25.54 
 
 
521 aa  140  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2392  hypothetical protein  29.45 
 
 
484 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0184  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.29 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.08 
 
 
464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  23.69 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000488544  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00830  predicted membrane protein  24.24 
 
 
520 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1545  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  22.46 
 
 
505 aa  124  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04550  predicted membrane protein  24.47 
 
 
528 aa  124  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2707  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  21.61 
 
 
504 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2491  hypothetical protein  27.55 
 
 
300 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0056  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.55 
 
 
300 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1946  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  34.66 
 
 
536 aa  94.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185929  normal  0.387022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0990  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.12 
 
 
512 aa  92.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl015  arginine-ornithine APC transporter  21.11 
 
 
521 aa  79.7  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0091  transporter, putative  21.05 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0803  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  22 
 
 
588 aa  68.6  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  25.97 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  26.91 
 
 
433 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>