93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0250 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  100 
 
 
371 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  98.38 
 
 
367 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  96.49 
 
 
367 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  96.49 
 
 
367 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  96.49 
 
 
367 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  96.76 
 
 
367 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  96.26 
 
 
345 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  70.77 
 
 
365 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  60.96 
 
 
361 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  63.97 
 
 
368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  60.81 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  59.62 
 
 
372 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  56.76 
 
 
367 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  56.79 
 
 
372 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  46.24 
 
 
360 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  46.46 
 
 
347 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  43.39 
 
 
356 aa  255  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  45.89 
 
 
351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  45.89 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  45.89 
 
 
349 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  44.86 
 
 
354 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  43.93 
 
 
356 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  43.93 
 
 
356 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  43.93 
 
 
356 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  43.61 
 
 
352 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  28.24 
 
 
393 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  28.06 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  28.06 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.87 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  33.62 
 
 
354 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  29.2 
 
 
346 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.32 
 
 
343 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  27.57 
 
 
341 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.03 
 
 
339 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  39.57 
 
 
359 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  28 
 
 
342 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  39.13 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  39.13 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  39.13 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  39.13 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  39.13 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  39.13 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.09 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  31.67 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  34.2 
 
 
345 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  42.52 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  31.59 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  31.56 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  40.69 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  25.71 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  33.81 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  33.81 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  27.3 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  26.79 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  26.47 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  34.97 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  28.95 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  28.95 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  28.95 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  28.95 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  24.53 
 
 
314 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  28.65 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  28.65 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  25.42 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  28.65 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  27.7 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  27.12 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.12 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.36 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  23.91 
 
 
363 aa  53.1  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.63 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  26.16 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  31.43 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  31.43 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  29.91 
 
 
530 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  31.43 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.43 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  27.94 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  26.09 
 
 
312 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  26.09 
 
 
312 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  26.09 
 
 
300 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.3 
 
 
439 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  25.96 
 
 
533 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  28.69 
 
 
524 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  29.41 
 
 
534 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  20.45 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  20.45 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  32.04 
 
 
523 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  20.24 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  30.09 
 
 
527 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.81 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  28.85 
 
 
528 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  25.52 
 
 
371 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>