63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0247 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  98.96 
 
 
193 aa  383  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  67.05 
 
 
185 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  68.6 
 
 
190 aa  241  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  68.82 
 
 
188 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  66.07 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  66.88 
 
 
178 aa  228  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  58.08 
 
 
176 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  57.83 
 
 
173 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  47.1 
 
 
164 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  47.1 
 
 
164 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  47.1 
 
 
164 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  47.1 
 
 
164 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  47.06 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  45.75 
 
 
173 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  45.28 
 
 
172 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  45.91 
 
 
172 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  45.91 
 
 
172 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  45.91 
 
 
172 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  40.51 
 
 
173 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.65 
 
 
184 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.27 
 
 
171 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.71 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  38.71 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  38.71 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  42.24 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  40.78 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.46 
 
 
175 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  31.15 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  40.36 
 
 
178 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  39.88 
 
 
186 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  39.88 
 
 
186 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  39.88 
 
 
186 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  39.88 
 
 
186 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  39.88 
 
 
186 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.06 
 
 
184 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  39.88 
 
 
182 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.65 
 
 
191 aa  101  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  38.71 
 
 
169 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  38.71 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  38.61 
 
 
180 aa  94.7  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  33.77 
 
 
170 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  35.03 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  30.2 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3433  hypothetical protein  30.59 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0760  hypothetical protein  30.59 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168942  normal  0.059645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3562  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.59 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  32.98 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  28.66 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  31.58 
 
 
248 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  26.09 
 
 
235 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  26.09 
 
 
235 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  25.61 
 
 
161 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  26.22 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  26.22 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.22 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  26.22 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>